cardiovascularКардиоваскулярная терапия и профилактикаCardiovascular Therapy and Prevention1728-88002619-0125«SILICEA-POLIGRAF» LLC10.15829/1728-8800-2022-3401cardiovascular-3401Research ArticleБИОБАНКИРОВАНИЕBIOBANKINGФормирование биобанка в структуре научных и лечебно-диагностических учреждений и перспективы межрегиональной интеграцииDevelopment of a biobank in the structure of scientific and diagnostic and treatment institutions and prospects for interregional integrationhttps://orcid.org/0000-0003-1791-7045КалининР. С.KalininR. S.

Калинин Роман Сергеевич — магистр биологических наук, младший научный сотрудник НИО экспериментальной медицинской вирусологии, молекулярной генетики и биобанкинга

Санкт-Петербург, 

Сургут, Ханты-Мансийский автономный округ — Югра

Saint-Petersburg, Surgut, Khanty-Mansi Autonomous Okrug — Yugra

pancu43@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0003-3285-9699ГолеваО. В.GolevaO. V.

Голева Ольга Владимировна — кандидат биологических наук, старший научный сотрудник НИО экспериментальной медицинской вирусологии, молекулярной генетики и биобанкинга

Санкт-Петербург

Saint-Petersburg

golev.ao@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0003-2711-748XИлларионовР. А.IllarionovR. A.

Илларионов Роман Арионович — инженер-исследователь биобанка "Генофонд", ФГБНУ "Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта"; младший научный сотрудник, БУ ВО ХМАО-Югры "Сургутский государственный университет"

Санкт-Петербург, 

Сургут, Ханты-Мансийский автономный округ — Югра

Saint-Petersburg, Surgut, Khanty-Mansi Autonomous Okrug — Yugra

r.a.illarionov@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0001-6488-8369ЦайВ. В.TsaiV. V.

Цай Виктория Викторовна — младший научный сотрудник НИО экспериментальной медицинской вирусологии, молекулярной генетики и биобанкинга, ФГБУ "Детский научно-клинический центр инфекционных болезней Федерального медико-биологического агентства"; младший научный сотрудник отдела геномной медицины, ФГБНУ "Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта"

Санкт-Петербург

Saint-Petersburg

viktoriya14054@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0003-2544-3265МукомоловаА. Л.MukomolovaA. L.

Мукомолова Анна Львовна  — кандидат медицинских наук, научный сотрудник НИО экспериментальной медицинской вирусологии, молекулярной генетики и  биобанкинга

Санкт-Петербург

Saint-Petersburg

amukomolova@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0002-0422-2060КонстантиноваЮ. Е.KonstantinovaYu. E.

Константинова Юлия Евгеньевна  — младший научный сотрудник НИО вакцинопрофилактики и  поствакцинальной патологии

Санкт-Петербург

 

Saint-Petersburg

konstantinova.ue@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0001-9922-401XМаркинИ. В.MarkinI. V.

Маркин Иван Васильевич  — аспирант НИО врожденных инфекционных заболеваний

Санкт-Петербург

Saint-Petersburg

i.v.markin@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0001-5952-8430КрыловА. В.KrylovA. V.

Крылов Андрей Витальевич  — кандидат биологических наук, старший научный сотрудник НИО экспериментальной медицинской вирусологии, молекулярной генетики и  биобанкинга

Санкт-Петербург

 

Saint-Petersburg

an.litovchenko@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0003-0968-6291РогозинаН. В.RogozinaN. V.

Рогозина Наталья Васильевна — кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник НИО врожденных инфекционных заболеваний

Санкт-Петербург

Saint-Petersburg

lelekin96@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0003-2923-1630БехтереваМ. К.BekhterevaM. K.

Бехтерева Мария Константиновна  — кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник НИО кишечных инфекций

Санкт-Петербург

Saint-Petersburg

Mkbechtereva@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0002-9799-5280ТянН. С.TyanM. S.

Тян Наталья Сергеевна  — младший научный сотрудник НИО капельных инфекций

Санкт-Петербург

Saint-Petersburg

tiannatalia94@yandex.ruhttps://orcid.org/0000-0003-3971-0117ОрловаЕ. Д.OrlovaE. D.

Орлова Елизавета Денисовна  — младший научный сотрудник НИО капельных инфекций

Санкт-Петербург

Saint-Petersburg

3x3.9@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0003-0120-4163ДонниковМ. Ю.DonnikovM. Yu.

Донников Максим Юрьевич  — кандидат медицинских наук, врач-лабораторный генетик, ведущий научный сотрудник научного-образовательного центра медицинского института

Сургут, Ханты-Мансийский автономный округ — Югра

Surgut, Khanty-Mansi Autonomous Okrug — Yugra

donnikov@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0002-0918-7129КоваленкоЛ. В.KovalenkoL. V.

Коваленко Людмила Васильевна  — доктор медицинских наук, директор медицинского института, заведующая кафедрой патофизиологии и  общей патологии

Сургут, Ханты-Мансийский автономный округ — Югра

Surgut, Khanty-Mansi Autonomous Okrug — Yugra

kovalenko_lv@surgu.ruhttps://orcid.org/0000-0002-2721-0150КолбасинЛ. Н.KolbasinL. N.

Колбасин Лев Николаевич — кандидат медицинских наук, заведующая медико-генетической консультацией, доцент кафедры кардиологии медицинского института

Сургут, Ханты-Мансийский автономный округ — Югра

Surgut, Khanty-Mansi Autonomous Okrug — Yugra

kollev@yandex.ruhttps://orcid.org/0000-0002-7465-4504ГлотовА. С.GlotovA. S.

Глотов Андрей Сергеевич — доктор биологических наук, руководитель отдела геномной медицины

Санкт-Петербург

Saint-Petersburg

anglotov@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0002-0091-2224ГлотовО. С.GlotovO. S.

Глотов Олег Сергеевич  — кандидат биологических наук, руководитель НИО экспериментальной медицинской вирусологии, молекулярной генетики и биобанкинга, старший научный сотрудник отдела геномной медицины

Санкт-Петербург

Saint-Petersburg

olglotov@mail.ruФГБУ "Детский научно-клинический центр инфекционных болезней Федерального медико-биологического агентства"; ФГБНУ "Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта"; БУ ВО ХМАО-Югры "Сургутский государственный университет"Pediatric Research and Clinical Center for Infectious Diseases of the Federal Medical and Biological Agency; D.O. Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology, and Reproductology; Surgut State UniversityФГБУ "Детский научно-клинический центр инфекционных болезней Федерального медико-биологического агентства"Pediatric Research and Clinical Center for Infectious Diseases of the Federal Medical and Biological AgencyФГБНУ "Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта"; БУ ВО ХМАО-Югры "Сургутский государственный университет"D.O. Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology, and Reproductology; Surgut State UniversityФГБУ "Детский научно-клинический центр инфекционных болезней Федерального медико-биологического агентства"; ФГБНУ "Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта"Pediatric Research and Clinical Center for Infectious Diseases of the Federal Medical and Biological Agency; D.O. Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology, and ReproductologyБУ ВО ХМАО-Югры "Сургутский государственный университет"Surgut State UniversityБУ ВО ХМАО-Югры "Сургутский государственный университет"; БУ ХМАО-Югры "Сургутский окружной клинический центр охраны материнства и детства"Surgut State University;ФГБНУ "Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта"D.O. Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology, and Reproductology202213092022211134013401Copyright © Калинин Р.С., Голева О.В., Илларионов Р.А., Цай В.В., Мукомолова А.Л., Константинова Ю.Е., Маркин И.В., Крылов А.В., Рогозина Н.В., Бехтерева М.К., Тян Н.С., Орлова Е.Д., Донников М.Ю., Коваленко Л.В., Колбасин Л.Н., Глотов А.С., Глотов О.С., 20222022Калинин Р.С., Голева О.В., Илларионов Р.А., Цай В.В., Мукомолова А.Л., Константинова Ю.Е., Маркин И.В., Крылов А.В., Рогозина Н.В., Бехтерева М.К., Тян Н.С., Орлова Е.Д., Донников М.Ю., Коваленко Л.В., Колбасин Л.Н., Глотов А.С., Глотов О.С.Kalinin R.S., Goleva O.V., Illarionov R.A., Tsai V.V., Mukomolova A.L., Konstantinova Y.E., Markin I.V., Krylov A.V., Rogozina N.V., Bekhtereva M.K., Tyan M.S., Orlova E.D., Donnikov M.Y., Kovalenko L.V., Kolbasin L.N., Glotov A.S., Glotov O.S.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://cardiovascular.elpub.ru/jour/article/view/3401

Формирование биобанков в  структуре научных и  лечебно-диагностических учреждений с  перспективами межрегиональной интеграции является основополагающим звеном мониторинга и прогнозирования заболеваний различного генеза, создания и испытания высокоэффективной диагностики, разработки новых терапевтических средств.

Цель

Цель. Описание стандартных операционных процедур и  принципов формировании биоресурсных коллекций (БРК) в медицинских учреждениях с организованным биобанкированием и возможности межструктурных взаимодействий.

Материал и  методы

Материал и  методы. Представлены данные научно-практических биомедицинских проектов, использующих БРК, полученные от пациентов с  наследственными, мультифакторными и  инфекционными заболеваниями в  г. Санкт-Петербурге и  г. Сургуте. На сентябрь 2022г БРК, собранная на базе ФГБУ "Детский научноклинический центр инфекционных болезней Федерального медико-биологического агентства" (г. Санкт-Петербург), включает биообразцы от 1619, а  БРК, собранная на базе Медицинского института Сургутского государственного университета (г. Сургут), включает биообразцы от 450 пациентов и условно здоровых лиц разного пола и  возраста. Отбор биообразцов от условно здоровых лиц и пациентов с различными заболеваниями и развившимися патологиями может послужить стратегически значимым ресурсом для будущих исследований в  плане этиологии, эпидемиологии, формирования нормативных баз и  шкал, инноваций в  развитии диагностических подходов и  лечении народонаселения Российской Федерации.

The formation of biobanks in the structure of scientific and treatment and diagnostic institutions with prospects for interregional integration is a fundamental link in monitoring and predicting diseases of various origins, creating and testing highly effective diagnostics, and developing novel therapeutic agents.

Aim

Aim. To describe standard operating procedures and principles for the formation of bioresource collections (BRC) in medical institutions with biobanking.

Material and methods

Material and methods. The data of scientific and practical biomedical projects using BRC obtained from patients with genetic, multifactorial and infectious diseases in St. Petersburg and Surgut are presented. As of September 2022, the BRC collected on the basis of the Pediatric Research and Clinical Center for Infectious Diseases of the Federal Medical and Biological Agency includes biosamples from 1619 patients, and the BRC collected in the Medical Institute of Surgut State University includes biosamples from 450 patients and healthy individuals of different sex and age. The selection of biosamples from apparently healthy individuals and patients with various diseases can serve as a strategically important resource for future research in terms of etiology, epidemiology, the development of regulatory environment and scales, innovations in the development of diagnostic approaches and treatment of the Russian population.

Биобанкбиоресурсная коллекцияпопуляционный биобанкнаселениеинфекционные болезнинаследственные заболеваниявирусологиягенетикастандартизацияbiobankbioresource collectionpopulation biobankpopulationinfectious diseasesgenetic diseasesvirologygeneticsstandardizationИсследование выполнено при финансовой поддержке Фонда научно-технологического развития Югры в рамках научного проекта № 2022-05-02 и № 2022-05-04The study was financially supported by the Fund for Scientific and Technological Development of Yugra within the research project № 2022-05-02 and № 2022-05-04ReferencesPrinz F, Schlange T, Asadullah K. Believe it or not: how much can we relyon published data on potential drug targets? Nat Rev Drug Disc. 2011;10(9):712. doi:10.1038/nrd3439-c1.Prinz F, Schlange T, Asadullah K. Believe it or not: how much can we relyon published data on potential drug targets? Nat Rev Drug Disc. 2011;10(9):712. doi:10.1038/nrd3439-c1.Резник О. Н., Кузьмин Д. О., Скворцов А.Е. и др. Биобанки — неоценимый ресурс трансплантации. История, современное состояние, перспективы. Вестник трансплантологии и искусственных органов. 2016;18(4):123-32. doi:10.15825/1995-1191-2016-4-123-132.Reznik ON, Kuzmin DO, Skvortsov AE, et al. Biobanks are an essential tool for transplantation. History, current state, perspectives. Russian Journal of Transplantology and Artificial Organs. 2016;18(4):123-32. (In Russ.) doi:10.15825/1995-1191-2016-4-123-132.Hewitt R, Watson P. Defining biobank. Biopreserv Biobank. 2013;11:309-15. doi:10.1089/bio.2013.0042.Hewitt R, Watson P. Defining biobank. Biopreserv Biobank. 2013;11:309-15. doi:10.1089/bio.2013.0042.OECD. Creation and Governance of Human Genetic Re - search Databases. OECD Publishing, Paris. 2006. doi:10.1787/9789264028531-en.OECD. Creation and Governance of Human Genetic Re - search Databases. OECD Publishing, Paris. 2006. doi:10.1787/9789264028531-en.Ilesanmi OS, Afolabi AA. Biobanking of COVID-19 specimens during the pandemic: The need for enhanced biosafety. Afr J Lab Med. 2021;10(1):1379. doi:10.4102/ajlm.v10i1.1379.Ilesanmi OS, Afolabi AA. Biobanking of COVID-19 specimens during the pandemic: The need for enhanced biosafety. Afr J Lab Med. 2021;10(1):1379. doi:10.4102/ajlm.v10i1.1379.Moore HM, Kelly AB, Jewell SD, et al. Biospecimen reporting for improved study quality (BRISQ). Cancer Cytopathol. 2011;119:92- 101. J Proteome Res. 2011;10:3429-3438. Biopreserv Biobank. 2011;9:57-70. doi:10.1089/bio.2010.0036.Moore HM, Kelly AB, Jewell SD, et al. Biospecimen reporting for improved study quality (BRISQ). Cancer Cytopathol. 2011;119:92- 101. J Proteome Res. 2011;10:3429-3438. Biopreserv Biobank. 2011;9:57-70. doi:10.1089/bio.2010.0036.Сивакова О.В., Покровская М. С., Метельская В. А. и др. Международные правила описания биообразцов — важный фактор повышения качества научных исследований. Профилактическая медицина. 2019;22(6):95-9. doi:10.17116/profmed20192206295.Sivakova OV, Pokrovskaya MS, Metelskaya VA, et al. International rules for description of biospecimens are an important factor in improving the quality of researches. Profilakticheskaya Meditsina. 2019;22(6):95-9. (In Russ.) doi:10.17116/profmed20192206295.Anisimov SV, Meshkov AN, Glotov AS, et al. et al. National Association of Biobanks and Biobanking Specialists: New Community for Promoting Biobanking Ideas and Projects in Russia. Biopreserv Biobank. 2021;19:73-82. doi:10.1089/bio.2020.0049.Anisimov SV, Meshkov AN, Glotov AS, et al. et al. National Association of Biobanks and Biobanking Specialists: New Community for Promoting Biobanking Ideas and Projects in Russia. Biopreserv Biobank. 2021;19:73-82. doi:10.1089/bio.2020.0049.Илларионов Р.А., Косякова О.В., Вашукова Е. С. и др. Особенности создания коллекции образцов беременных женщин на разных сроках гестации для поиска ранних биомаркеров преждевременных родов. Кардиоваскулярная терапия и профилактика. 2020;19(6):2708. doi:10.15829/1728-8800-2020-2708.Illarionov RA, Kosyakova OV, Vashukova ES, et al. Collection of samples from women at different stages of pregnancy to search for early biomarkers of preterm birth. Cardiovascular Therapy and Prevention. 2020;19(6):2708. (In Russ.) doi:10.15829/1728-8800-2020-2708.Liu Y, Gao H, Hu Y, et al. Quality Control System in an Obstetrics and Gynecology Disease Biobank. Biopreserv Biobank. 2019; 17(1):27-38. doi:10.1089/bio.2018.0056.Liu Y, Gao H, Hu Y, et al. Quality Control System in an Obstetrics and Gynecology Disease Biobank. Biopreserv Biobank. 2019; 17(1):27-38. doi:10.1089/bio.2018.0056.Kinkorová J. Education for future biobankers — The state-ofthe-art and outlook. EPMA. 2021;10;12(1):15-25. doi:10.1007/s13167-021-00234-5.Kinkorová J. Education for future biobankers — The state-ofthe-art and outlook. EPMA. 2021;10;12(1):15-25. doi:10.1007/s13167-021-00234-5.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.