Покровская Мария Сергеевна — кандидат биологических наук, ведущий научный сотрудник, руководитель лаборатории "Банк биологического материала"
Москва
SPIN-код 2886-6605
Moscow
Борисова Анна Львовна — ведущий инженер лаборатории "Банк биологического материала"
Москва
SPIN-код 7454-8504
Moscow
Кондрацкая Виктория Александровна — младший научный сотрудник лаборатории "Банк биологического материала"
Москва
SPIN-код 3839-8987
Moscow
Ефимова Ирина Александровна — ведущий эксперт лаборатории "Банк биологического материала"
Москва
SPIN-код 8533-2454
Moscow
Ершова Александра Игоревна — доктор медицинских наук, руководитель лаборатории клиномики, заместитель директора по фундаментальной науке
Москва
SPIN-код 5292-5612
Moscow
Драпкина Оксана Михайловна — доктор медицинских наук, профессор, академик РАН, директор
Москва
SPIN-код 4456-1297
Moscow
Цель. Создание и валидация алгоритма автоматического аликвотирования образцов сыворотки и плазмы крови для биобанкирования в рамках широкомасштабного научного исследования.
Материал и методы. Биобанк НМИЦ ТПМ оснащен системой автоматического аликвотирования марки Tecan. При составлении программы аликвотирования (скрипта) подбирали следующие параметры: время, затрачиваемое на раскапывание одного полного криоштатива, вместимостью 96 криопробирок, оптимальное количество вакутейнеров и наконечников при однократной загрузке прибора. Программу создавали для получения за один цикл загрузки прибора от 8-ми участников суммарно от каждого по 12 аликвот объемом 0,5 мл сыворотки крови, плазмы с этилендиаминтетрауксусной кислотой и плазмы с цитратом натрия в криопробирках на 1 мл. Проводили сравнительную оценку автоматического и ручного раскапывания по параметрам времени, затраченного на пробоподготовку, и качества получаемых аликвот.
Результаты. Разработана и валидирована методика проведения преаналитического этапа крупномасштабного научного исследования, основанная на автоматизации процесса аликвотирования биообразцов, созданы скрипты для аликвотирования сыворотки и плазмы крови на автоматизированной станции Tecan Freedom EVO. Эксперимент, проведенный на биоматериале от 64 участников, показал, что при ожидаемом потоке в 32 участника в день для раскапывания в ручном режиме требовалось >2 ч, а при автоматическом (4 запуска роботааликвотера по 24 вакутейнера от 8-ми участников) <1,5 ч при полном исключении ошибок, связанных с влиянием человеческого фактора.
Заключение. Автоматическое раскапывание имеет ряд преимуществ в сравнении с ручным: позволяет гарантировать стандартизацию и эффективность проведения пробоподготовки, сократить время и увеличить точность аликвотирования биоматериала, сэкономить место в морозильных камерах длительного хранения, благодаря использованию криопробирок меньшего объема. Разработанный алгоритм написания программ аликвотирования и проведения расчетов оптимального использования расходных материалов может быть использован и в других проектах.
Aim. To create and validate an algorithm for automatic aliquoting of serum and plasma samples for biobanking as part of a large-scale study.
Material and methods. Biobank of the National Medical Research Center for Therapy and Preventive Medicine is equipped with a Tecan automated aliquoting system. When compiling the aliquoting program (script), the following parameters were selected: the time spent on spotting one complete cryobox, with a capacity of 96 cryotubes, the optimal number of vacutainers and tips for a single loading of the device. The program was created to receive 12 aliquots of 0,5 ml of blood serum, plasma with ethylenediaminetetraacetic acid and plasma with sodium citrate in cryotubes per 1 ml from eight participants in total from each in one cycle of device loading. Automatic and manual spotting was assessed in terms of the time spent on sample preparation and the quality of the aliquots obtained.
Results. A methodology for conducting the preanalytical phase of a large-scale study based on the automation of biosample aliquoting has been developed and validated. We created scripts for aliquoting serum and blood plasma at the automated Tecan Freedom EVO system. An experiment conducted on biomaterial from 64 participants showed, that with an expected flow of 32 participants per day, it took more than 2 hours for manual aliquoting, and for automatic aliquoting (4 launches of the aliquot robot for 24 vacutainers from 8 participants) — less than 1,5 hours with the complete exclusion of human errors.
Conclusion. Automated aliquoting has a following number of advantages in comparison with manual: it allows to guarantee standardization and efficiency of sample preparation, reduce the time and increase the accuracy of aliquoting of biomaterial, save space in long-term storage freezers due to the use of smaller cryotubes. The developed algorithm for creating aliquoting programs and calculating the optimal use of consumables can be used in other projects.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.