cardiovascularКардиоваскулярная терапия и профилактикаCardiovascular Therapy and Prevention1728-88002619-0125«SILICEA-POLIGRAF» LLC10.15829/1728-8800-2022-3417cardiovascular-3417Research ArticleБИОБАНКИРОВАНИЕBIOBANKINGКонцепция национальной информационной платформы биобанков Российской ФедерацииThe concept of the national information platform of biobanks of the Russian Federationhttps://orcid.org/0000-0001-5989-6233МешковА. Н.MeshkovA. N.

Мешков Алексей Николаевич — кандидат медицинских наук, руководитель лаборатории "Молекулярная генетика"

Москва

SPIN 6340-5187

Moscow

meshkov@lipidclinic.ruЯрцеваО. Ю.YartsevaO. Yu.

Ярцева Ольга Юрьевна  — заместитель директора по развитию

Москва

 

Moscow

ob@bars.grouphttps://orcid.org/0000-0003-4020-6647БорисоваА. Л.BorisovaA. L.

Борисова Анна Львовна  — ведущий инженер лаборатории "Банк биологического материала"

Москва

SPIN 7454-8504

Moscow

a.borisova0108@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0001-6985-7131ПокровскаяМ. С.PokrovskayaM. S.

Покровская Мария Сергеевна — ведущий научный сотрудник, руководитель лаборатории "Банк биологического материала"

Москва

SPIN 2886-6605

Moscow

mpokrovskaia@list.ruhttps://orcid.org/0000-0002-4453-8430ДрапкинаО. М.DrapkinaO. M.

Драпкина Оксана Михайловна — доктор медицинских наук, профессор, академик РАН, директор

Москва

SPIN 4456-1297

Moscow

Drapkina@bk.ruФГБУ "Национальный медицинский исследовательский центр терапии и профилактической медицины" Минздрава РоссииNational Medical Research Center for Therapy and Preventive MedicineООО «Геном Эксперт»OOO Genome Expert202215092022211134173417Copyright © Мешков А.Н., Ярцева О.Ю., Борисова А.Л., Покровская М.С., Драпкина О.М., 20222022Мешков А.Н., Ярцева О.Ю., Борисова А.Л., Покровская М.С., Драпкина О.М.Meshkov A.N., Yartseva O.Y., Borisova A.L., Pokrovskaya M.S., Drapkina O.M.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://cardiovascular.elpub.ru/jour/article/view/3417Цель

Цель. Создание концепции национальной информационной платформы биобанков Российской Федерации (НИПБ РФ).

Материал и методы

Материал и методы. Для создания концепции НИПБ РФ в НАСБИО (Национальная ассоциация биобанков и  специалистов по биобанкированию) в  апреле 2022г была сформирована экспертная группа, состоящая из 17 представителей российских биобанков. Был проведен анализ международных практик в  этой области. Для оценки состояния инфраструктуры российских биобанков в  части технологии информационного сопровождения хранящегося биоматериала членами экспертной группы была сформирована анкета, состоящая из нескольких блоков вопросов. Анкетирование проводилось с  апреля по июнь 2022г среди представителей российских биобанков  — членов НАСБИО. Для анализа результатов анкетирования применялись методы описательной статистики.

Результаты

Результаты. Всего в  анкетировании приняли участие представители 16 биобанков (4 биобанка входят в структуру образовательных учреждений, 10  — в  структуру научных медицинских учреждений, 1  — в  немедицинское научное учреждение и  1 биобанк организован в  рамках частно-государственного партнерства). Объем хранилищ биобанков варьируется от 2 до 800 тыс. единиц хранения. Показано, что большинство хранилищ (81%) используют информационные системы для внесения и хранения данных, ассоциированных с биообразцами. Биобанки используют зарубежные и российские программные продукты (53 и 47%, соответственно), при этом треть разрабатывает собственные информационные системы. Сформулирована концепция НИПБ РФ как информационной системы, предназначенной для консолидации, обработки и использования данных о биообразцах и коллекциях биобанков страны для развития российского биобанкирования и повышения эффективности и качества научно-медицинских исследований.

Заключение

Заключение. Предполагается, что создание НИПБ РФ позволит улучшить взаимодействие между биобанками и конечными пользователями их услуг и будет способствовать развитию биомедицинской науки в России.

Aim

Aim. To create the concept of the national information platform of biobanks of the Russian Federation (NIPB RF).

Material and methods

Material and methods. In April 2022, an expert group consisting of 17 representatives of Russian biobanks was formed in National Association of Biobanks and Biobanking Specialists to create the concept of the NIPB RF. An analysis of international practices in this area was carried out. To assess the infrastructure of Russian biobanks in terms of information support for stored biomaterial, experts formed a questionnaire consisting of several blocks of questions. The survey was conducted from April to June 2022 among representatives of Russian biobanks. Descriptive statistics were used to analyze the results of the survey.

Results

Results. In total, representatives of 16 biobanks took part in the survey. The storage capacity of biobanks varies from 2000 to 800000 storage units. It is shown that the majority of biobanks (81%) use information systems for entering and storing related data. Biobanks use foreign and Russian software products (53 and 47%, respectively), while a  third develop their own information systems. We formulated the NIPB RF concept as an information system designed for consolidating, processing and using data on biosamples for the development of Russian biobanking and improving the efficiency and quality of research.

Conclusion

Conclusion. The creation of the NIPB RF will improve the interaction between biobanks and end users and will develop biomedicine in Russia.

биобанкбиобанкированиеинформационная системабаза данных.biobankbiobankinginformation systemdatabaseReferencesБиобанкирование. Национальное руководство. / под редакцией А. Н. Мешкова, А. С. Глотова, С.В. Анисимова. Национальная ассоциация биобанков и специалистов по биобанкированию. М.: Изд-во Триумф, 2022. 308 с. ил. ISBN: 978-5- 93673-322-2.Biobanking. National Guidelines. Ed. A. N. Meshkova, A.S. Glotova, S.V. Anisimova. National association of Biobanks and biobanking specialists. M.: Izd-vo Triumf, 2022. 308 р. il. (In Russ.) ISBN: 978-5- 93673-322-2.Anisimov SV, Meshkov AN, Glotov AS, et al. National Association of Biobanks and Biobanking Specialists: New Community for Promoting Biobanking Ideas and Projects in Russia. Biopreserv Biobank. 2021;19(1):73-82. doi:10.1089/bio.2020.0049.Anisimov SV, Meshkov AN, Glotov AS, et al. National Association of Biobanks and Biobanking Specialists: New Community for Promoting Biobanking Ideas and Projects in Russia. Biopreserv Biobank. 2021;19(1):73-82. doi:10.1089/bio.2020.0049.Elliott P, Peakman TC. The UK Biobank sample handling and storage protocol for the collection, processing and archiving of human blood and urine. Int J Epidemiol. 2008;37(2):234-44. doi:10.1093/ije/dym276.Elliott P, Peakman TC. The UK Biobank sample handling and storage protocol for the collection, processing and archiving of human blood and urine. Int J Epidemiol. 2008;37(2):234-44. doi:10.1093/ije/dym276.Cho SY, Hong EJ, Nam JM, et al. Opening of the national biobank of Korea as the infrastructure of future biomedical science in Korea. Osong Public Health Res Perspect. 2012;3(3):177-84. doi:10.1016/j.phrp.2012.07.004.Cho SY, Hong EJ, Nam JM, et al. Opening of the national biobank of Korea as the infrastructure of future biomedical science in Korea. Osong Public Health Res Perspect. 2012;3(3):177-84. doi:10.1016/j.phrp.2012.07.004.Klingler C, von Jagwitz-Biegnitz M, Hartung ML, et al. Evaluating the German Biobank Node as Coordinating Institution of the German Biobank Alliance: Engaging with Stakeholders via Survey Research. Biopreserv Biobank. 2020;18(2):64-72. doi:10.1089/bio.2019.0060.Klingler C, von Jagwitz-Biegnitz M, Hartung ML, et al. Evaluating the German Biobank Node as Coordinating Institution of the German Biobank Alliance: Engaging with Stakeholders via Survey Research. Biopreserv Biobank. 2020;18(2):64-72. doi:10.1089/bio.2019.0060.Trehearne A. Genetics, lifestyle and environment. UK Biobank is an open access resource following the lives of 500,000 participants to improve the health of future generations. Bundesgesundheitsblatt Gesundheitsforschung Gesundheitsschutz. 2016;59(3):361-7. doi:10.1007/s00103-015-2297-0.Trehearne A. Genetics, lifestyle and environment. UK Biobank is an open access resource following the lives of 500,000 participants to improve the health of future generations. Bundesgesundheitsblatt Gesundheitsforschung Gesundheitsschutz. 2016;59(3):361-7. doi:10.1007/s00103-015-2297-0.Merino-Martinez R, Norlin L, van Enckevort D, et al. Toward Global Biobank Integration by Implementation of the Minimum Information About BIobank Data Sharing (MIABIS 2.0 Core). Biopreserv Biobank. 2016;14(4):298-306. doi:10.1089/bio.2015.0070.Merino-Martinez R, Norlin L, van Enckevort D, et al. Toward Global Biobank Integration by Implementation of the Minimum Information About BIobank Data Sharing (MIABIS 2.0 Core). Biopreserv Biobank. 2016;14(4):298-306. doi:10.1089/bio.2015.0070.Lehmann S, Guadagni F, Moore H, et al. Standard preanalytical coding for biospecimens: review and implementation of the Sample PREanalytical Code (SPREC). Biopreserv Biobank. 2012;10(4):366-74. doi:10.1089/bio.2012.0012.Lehmann S, Guadagni F, Moore H, et al. Standard preanalytical coding for biospecimens: review and implementation of the Sample PREanalytical Code (SPREC). Biopreserv Biobank. 2012;10(4):366-74. doi:10.1089/bio.2012.0012.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.