cardiovascularКардиоваскулярная терапия и профилактикаCardiovascular Therapy and Prevention1728-88002619-0125«SILICEA-POLIGRAF» LLC10.15829/1728-8800-2023-3720cardiovascular-3720Research ArticleБИОБАНКИРОВАНИЕBIOBANKINGВеб-репозиторий "БиоВитрина" — доступ к информации о биоресурных коллекцияхBioVitrina web repository — access to data on bioresource collectionshttps://orcid.org/0000-0002-6854-0308БукрееваА. С.BukreevaA. S.

Анастасия Сергеевна Букреева — младший научный сотрудник.

Moscow

Moscow

3385142@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0001-9404-1660МальсаговаК. А.MalsagovaK. A.

Кристина Ахмедовна Мальсагова — кандидат медицинских наук.

Moscow

Moscow

kristina.malsagova86@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0001-9367-9785ИзотовА. А.IzotovA. A.

Александр Анатольевич Изотов — научный сотрудник.

Moscow

Moscow

farmsale@yandex.ruhttps://orcid.org/0000-0003-2852-102XЛисицаА. В.LisitsaA. V.

Андрей Валерьевич Лисица — доктор биологических наук, главный научный сотрудник.

Moscow

Moscow

lisitsa058@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0003-4472-2016КайшеваА. Л.KaishevaA. L.

Анна Леонидовна Кайшева — доктор биологических наук, старший научный сотрудник.

Moscow

Moscow

kaysheva@gmail.comФГБНУ "Научно- исследовательский институт биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича" (ИБМХ)V.N. Orekhovich Research Institute of Biomedical Chemistry2023101220232211Биобанкирование37203720Copyright © Букреева А.С., Мальсагова К.А., Изотов А.А., Лисица А.В., Кайшева А.Л., 20232023Букреева А.С., Мальсагова К.А., Изотов А.А., Лисица А.В., Кайшева А.Л.Bukreeva A.S., Malsagova K.A., Izotov A.A., Lisitsa A.V., Kaisheva A.L.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://cardiovascular.elpub.ru/jour/article/view/3720Цель

Цель. Разработка веб-репозитория "БиоВитрина" для визуализации информации об имеющихся в организации образцах биологического происхождения (https://bb.ibmc.msk.ru).

Материал и методы

Материал и методы. Использовался следующий набор инструментов: PostgreSQL 12, скриптовый язык программирования Python 3.8, Django 3.2.7, Angular 12.2.13, Nginx, Docker 3, Redis 6.

Результаты

Результаты. Биологические образцы в каталоге систематизированы согласно международной классификации болезней 10 пересмотра (МКБ-10). После выбора наиболее подходящих под научную задачу биообразцов Пользователь имеет возможность оформить запрос на их получение. Необходимым условием для получения биологических образцов является последующая публикация результатов экспериментальных исследований в веб-репозитории "БиоВитрина". Такой обмен аналитическими результатами исследований позволит избежать повторения схожих исследований и будет способствовать сохранению материальных ресурсов.

Заключение

Заключение. "БиоВитрина" разработана с целью оптимизации инфраструктуры биобанков организаций и обеспечения доступности информации об имеющихся у них биоресурных коллекций. Это позволит решить множество вопросов, связанных с использованием различных типов биоматериала, как в исследовательских, так и в клинических целях в области персонализированной биомедицины.

Aim

Aim. To develop the BioVitrina web repository for visualizing data on biological samples available in the organization (https://bb.ibmc.msk.ru).

Material and methods

Material and methods. The following set of tools was used: PostgreSQL 12, Python 3.8 scripting language, Django 3.2.7, Angular 12.2.13, Nginx, Docker 3, Redis 6.

Results

Results. Biological samples are systematized according to the International Classification of Diseases, 10th revision (ICD-10). After selecting the most suitable biosamples, the User has the opportunity to submit a request for their receipt. A necessary condition for obtaining biological samples is the subsequent publication of the results of experimental studies in the BioVitrina web repository. Such an exchange of analytical research results will avoid repetition of similar studies and will contribute to the conservation of material resources.

Conclusion

Conclusion. "BioVitrina" was developed to optimize the infrastructure of biobanks of organizations and ensure the availability of information about their existing bioresource collections. This will solve many issues related to the use of different types of biomaterials, both for research and clinical purposes in personalized biomedicine.

биологические образцыбиоколлекциявебрепозиторийbiological samplesbiocollectionweb repositoryРабота выполнена в рамках проекта по созданию и развитию научных центров мирового уровня "Цифровой дизайн и персонализированное здравоохранение" при финансовой поддержке Министерства образования и науки Российской Федерации (соглашение № 075-15-2022-305)The work was carried out within the project for the creation and development of world- class scientific centers "Digital Design and Personalized Healthcare" with the financial support of the Ministry of Education and Science of the Russian Federation (agreement № 075-15-2022-305)ReferencesГутор C. С., Энглевский Н. А., Прокудина Д. В. и др. Банк биологического материала: информационное сопровождение и физическое воплощение. Врач и информационные технологии. 2013;4:31­9.Gutor CS, Englevskij NA, Prokudina DV, et al. Bank biologicheskogo materiala: informacionnoe soprovozhdenie i fizicheskoe voploshchenie. Vrach i informacionnye tekhnologii. 2013;4:31­9. (In Russ.)Jang TH, Park SC, Yang JH et al. Cryopreservation and its clinical applications. Integrative Medicine Research. 2017;6(1):12­8. doi:10.1016/j.imr.2016.12.001.Jang TH, Park SC, Yang JH et al. Cryopreservation and its clinical applications. Integrative Medicine Research. 2017;6(1):12­8. doi:10.1016/j.imr.2016.12.001.Lehmann S, Guadagni F, Moore H, et al. International Society for Biological and Environmental Repositories (ISBER) Working Group on Biospecimen Science. Standard preanalytical coding for biospecimens: review and implementation of the Sample PRE analytical Code (SPREC). Biopreserv Biobank. 2012;10(4):366­74. doi:10.1089/bio.2012.0012.Lehmann S, Guadagni F, Moore H, et al. International Society for Biological and Environmental Repositories (ISBER) Working Group on Biospecimen Science. Standard preanalytical coding for biospecimens: review and implementation of the Sample PRE analytical Code (SPREC). Biopreserv Biobank. 2012;10(4):366­74. doi:10.1089/bio.2012.0012.Mitchell C, Gramatiuk S, Sarkisian T, et al. Biobanking IT Systems, Database Structure and Web Applications. In: Sargsyan K, Huppertz B, Gramatiuk S, ed. Biobanks in Low­ and Middle­ Income Countries: Relevance, Setup and Management. Springer, Cham. 2022. pp. 81­89. doi:10.1007/978­3­030­87637­1_12.Mitchell C, Gramatiuk S, Sarkisian T, et al. Biobanking IT Systems, Database Structure and Web Applications. In: Sargsyan K, Huppertz B, Gramatiuk S, ed. Biobanks in Low­ and Middle­ Income Countries: Relevance, Setup and Management. Springer, Cham. 2022. pp. 81­89. doi:10.1007/978­3­030­87637­1_12.Мешков А. Н., Ярцева О. Ю., Борисова А. Л. и др. Концепция национальной информационной платформы биобанков Российской Федерации. Кардиоваскулярная терапия и профилактика. 2022;21(11):3417. doi:10.15829/1728­8800­2022­3417.Meshkov AN, Yartseva OYu, Borisova AL, et al. The concept of the national information platform of biobanks of the Russian Federation. Cardiovascular Therapy and Prevention. 2022;21(11):3417. (In Russ.) doi:10.15829/1728­8800­2022­3417.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.