cardiovascularКардиоваскулярная терапия и профилактикаCardiovascular Therapy and Prevention1728-88002619-0125«SILICEA-POLIGRAF» LLC10.15829/1728-8800-2023-3749cardiovascular-3749Research ArticleБИОБАНКИРОВАНИЕBIOBANKINGБиобанкирование в стационаре многопрофильного научного медицинского центра как потенциал для широкого спектра научных исследований. Часть I. Организационно-методические аспектыBiobanking in the hospital of a multidisciplinary research medical center as a potential for a wide research range. Part I. Organizational and methodological aspectshttps://orcid.org/0000-0003-4020-6647БорисоваА. Л.BorisovaA. I.

Анна Львовна Борисова — ведущий инженер лаборатории "Банк биологического материала".

Москва

Moscow

a.borisova0108@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0001-5397-5387КопыловаО. В.KopylovaO. V.

Оксана Викторовна Копылова — старший научный сотрудник лаборатории клиномики, врач-кардиолог.

Москва

Moscow

osivakova@gnicpm.ruhttps://orcid.org/0000-0001-6985-7131ПокровскаяМ. С.PokrovskayaM. S.

Мария Сергеевна Покровская — кандидат биологических наук, ведущий научный сотрудник, руководитель лаборатории "Банк биологического материала".

Москва

Moscow

mpokrovskaia@list.ruhttps://orcid.org/0000-0002-3081-8415ЕфимоваИ. А.EfimovaI. A.

Ирина Александровна Ефимова — ведущий эксперт лаборатории "Банк биологического материала".

Москва

Moscow

biobank@gnicpm.ruhttps://orcid.org/0000-0003-3150-5194ПустеленинА. В.PusteleninA. V.

Антон Владимирович Пустеленин — программист службы информационных технологий.

Москва

Moscow

avp@gnicpm.ruhttps://orcid.org/0000-0001-7989-0760ЕршоваА. И.ErshovaА. I.

Александра Игоревна Ершова — доктор медицинских наук, руководитель лаборатории клиномики.

Москва

Moscow

AErshova@gnicpm.ruhttps://orcid.org/0000-0002-4453-8430ДрапкинаО. М.DrapkinaO. M.

Оксана Михайловна Драпкина — доктор медицинских наук, профессор, академик РАН, директор.

Москва

Moscow

drapkina@bk.ruФГБУ "Национальный медицинский исследовательский центр терапии и профилактической медицины" Минздрава РоссииNational Medical Research Center for Therapy and Preventive Medicine2023091220232211Биобанкирование37493749Copyright © Борисова А.Л., Копылова О.В., Покровская М.С., Ефимова И.А., Пустеленин А.В., Ершова А.И., Драпкина О.М., 20232023Борисова А.Л., Копылова О.В., Покровская М.С., Ефимова И.А., Пустеленин А.В., Ершова А.И., Драпкина О.М.Borisova A.I., Kopylova O.V., Pokrovskaya M.S., Efimova I.A., Pustelenin A.V., Ershova А.I., Drapkina O.M.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://cardiovascular.elpub.ru/jour/article/view/3749Цель

Цель. Разработка алгоритма и организация сплошного биобанкирования образцов цельной крови, сыворотки и плазмы крови пациентов стационара ФГБУ "НМИЦ ТПМ" Минздрава России для создания подробно аннотированной, благодаря интеграции электронных историй болезни и базы данных биобанка, коллекции биообразцов.

Материал и методы

Материал и методы. В исследование включаются все пациенты, поступающие в стационар ФГБУ "НМИЦ ТПМ" Минздрава России в отделения разного профиля, подписавшие информированное согласие на биобанкирование. Клиническая информация собирается в рамках обследования пациентов и сохраняется в электронных историях болезни в медицинской информационной системе "Медиалог". Биобанкирование крови и ее производных осуществляется в соответствии со стандартными операционными процедурами. От каждого пациента в стандартных условиях сохраняется по 12 аликвот сыворотки и плазмы крови, а также 1 пробирка цельной крови с калиевой солью этилендиаминтетрауксусной кислоты (К2ЭДТА). Информация о биообразцах, идентификационные номера пациентов и координаты расположения в хранилище, содержатся в базе данных биобанка.

Результаты

Результаты. Разработан и внедрен в практику алгоритм сплошного биобанкирования биоматериала и данных стационарных пациентов. Коллекция, собираемая по данному алгоритму в течение 10 мес. и по настоящее время, связана с большими биомедицинскими данными, хранящимися в медицинской информационной системе, лабораторной информационной системе и биобанке. Объединенные базы данных позволяют вести поиск образцов в коллекции по заданным критериям.

Заключение

Заключение. Создаваемая по разработанному алгоритму коллекция подробно аннотированных биообразцов может быть использована для широкого спектра научных исследований путем формирования выборок пациентов по необходимым критериям. Разработанный алгоритм сплошного биобанкирования в стационаре может быть использован в различных медицинских центрах, оснащенных биобанками.

Aim

Aim. To develop an algorithm and manage total biobanking of samples of whole blood, serum and plasma of patients in the hospital of the National Medical Research Center for Therapy and Preventive Medicine in order to create a detailed biosample collection through the integration of electronic medical records and a biobank database.

Material and methods

Material and methods. The study includes all patients admitted to the hospital of the National Medical Research Center for Therapy and Preventive Medicine in various departments who signed informed consent for biobanking. Clinical information is collected as part of patient examination and stored in electronic medical records in the Medialog medical information system. Biobanking of blood and related products is carried out in accordance with standard operating procedures. From each patient, 12 aliquots of serum and blood plasma are stored, as well as 1 tube of whole blood with ethylenediaminetetraacetic acid potassium salt. Information about biospecimens, patient identification numbers and storage location coordinates are contained in the biobank database.

Results

Results. An algorithm for total biobanking of biomaterial and data from inpatients has been developed and put into practice. This collection is associated with large biomedical data stored in a medical information system, laboratory information system and biobank. The combined databases make it possible to search for samples in the collection according to specified criteria.

Conclusion

Conclusion. The collection developed can be used for a wide range of studies by forming patient samples according to the necessary criteria. The developed algorithm for total biobanking in a hospital can be used in various medical centers equipped with biobanks.

биобанкбиобанкированиебиообразцыбольшие данныеорганизация биобанкированиябаза данныхинформационные системыbiobankbiobankingbiosamplesbig databiobanking organizationdatabaseinformation systemsРабота проводилась в рамках государственного задания "Разработка интегрированных систем прогнозирования в персонализированной медицине" № 121021700364-1The work was carried out within the state acknowledgement "Development of integrated prediction systems in personalized medicine" № 121021700364-1ReferencesSwede H, Stone C, Norwood A. National population­ based biobanks for genetic research. Genet Med. 2007;9:141­9. doi:10.1097/GIM.0b013e3180330039.Swede H, Stone C, Norwood A. National population­ based biobanks for genetic research. Genet Med. 2007;9:141­9. doi:10.1097/GIM.0b013e3180330039.Al Kuwari H, Al Thani A, Al Marri A, et al. The Qatar Biobank: background and methods. BMC Public Health. 2015;15:1208. doi:10.1186/s12889­015­2522­7.Al Kuwari H, Al Thani A, Al Marri A, et al. The Qatar Biobank: background and methods. BMC Public Health. 2015;15:1208. doi:10.1186/s12889­015­2522­7.Al Thani A, Fthenou E, Paparrodopoulos S, et al. Qatar Biobank Cohort Study: Study Design and First Results. Am J Epidemiol. 2019;188(8):1420­33. doi:10.1093/aje/kwz084.Al Thani A, Fthenou E, Paparrodopoulos S, et al. Qatar Biobank Cohort Study: Study Design and First Results. Am J Epidemiol. 2019;188(8):1420­33. doi:10.1093/aje/kwz084.Sudlow C, Gallacher J, Allen N, et al. UK biobank: an open access resource for identifying the causes of a wide range of complex diseases of middle and old age. PLoS Med. 2015;31;12(3):e1001779. doi:10.1371/journal.pmed.1001779.Sudlow C, Gallacher J, Allen N, et al. UK biobank: an open access resource for identifying the causes of a wide range of complex diseases of middle and old age. PLoS Med. 2015;31;12(3):e1001779. doi:10.1371/journal.pmed.1001779.Leitsalu L, Haller T, Esko T, et al. Cohort Profile: Estonian Biobank of the Estonian Genome Center, University of Tartu. Int J Epidemiol. 2015;44(4):1137­47. doi:10.1093/ije/dyt268.Leitsalu L, Haller T, Esko T, et al. Cohort Profile: Estonian Biobank of the Estonian Genome Center, University of Tartu. Int J Epidemiol. 2015;44(4):1137­47. doi:10.1093/ije/dyt268.McDavid A, Crane PK, Newton KM, et al. Enhancing the power of genetic association studies through the use of silver standard cases derived from electronic medical records. PLoS One. 2013;10;8(6):e63481. doi:10.1371/journal.pone.0063481.McDavid A, Crane PK, Newton KM, et al. Enhancing the power of genetic association studies through the use of silver standard cases derived from electronic medical records. PLoS One. 2013;10;8(6):e63481. doi:10.1371/journal.pone.0063481.Macheiner T, Huppertz B, Sargsyan K. Biobanking. Nachhaltige Nutzung biologischer Ressourcen am Beispiel der Biobank Graz [Biobanking. Sustainable use of biological resources on the example of the Biobank Graz]. Pathologe. 2013;34(4):366­9. German. doi:10.1007/s00292­013­1752­7.Macheiner T, Huppertz B, Sargsyan K. Biobanking. Nachhaltige Nutzung biologischer Ressourcen am Beispiel der Biobank Graz [Biobanking. Sustainable use of biological resources on the example of the Biobank Graz]. Pathologe. 2013;34(4):366­9. German. doi:10.1007/s00292­013­1752­7.Копылова О. В., Ершова А. И., Покровская М. С. и др. Популяционно­ нозологический исследовательский биобанк "НМИЦ ТПМ": анализ коллекций биообразцов, принципы сбора и хранения информации. Кардиоваскулярная терапия и профилактика. 2021;20(8):3119. doi:10.15829/1728­88002021­3119.Kopylova OV, Ershova AI, Pokrovskaya MS, et al. Population­ nosological research biobank of the National Medical Research Center for Therapy and Preventive medicine: analysis of biosamples, principles of collecting and storing information. Cardiovascular Therapy and Prevention. 2021;20(8):3119. (In Russ.) doi:10.15829/1728­88002021­3119.Драпкина О. М., Шальнова С. А., Имаева А.Э и др. Эпидемиология сердечно­ сосудистых заболеваний и их факторов риска в регионах Российской Федерации. Третье исследование (ЭССЕ­РФ3). Обоснование и дизайн исследования. Кардиоваскулярная терапия и профилактика. 2022;21(5):3246. doi:10.15829/1728­8800­2022­3246.Drapkina OM, Shalnova SA, Imaeva AE, et al. Epidemiology of cardiovascular diseases in regions of Russian Federation. Third survey (ESSE­RF­3). Rationale and study design. Cardiovascular Therapy and Prevention. 2022;21(5):3246. (In Russ.) doi:10.15829/1728­8800­2022­3246.Покровская М. С., Борисова А. Л., Метельская В. А. и др. Роль биобанкирования в организации крупномасштабных эпидемиологических исследований. Кардиоваскулярная терапия и профилактика. 2021;20(5):2958. doi:10.15829/17288800­2021­2958.Pokrovskaya MS, Borisova AL, Metelskaya VA, et al. Role of biobanking in managing large­ scale epidemiological studies. Cardiovascular Therapy and Prevention. 2021;20(5):2958. (In Russ.). doi:10.15829/17288800­2021­2958.Покровская М. С., Сивакова О. В., Мешков А. Н. и др. Организация биобанкирования биообразцов в рамках второго этапа эпидемиологического исследования сердечно­ сосудистых факторов риска и заболеваний в регионах Российской Федерации (ЭССЕ­РФ2). Профилактическая медицина. 2018;21(2­2):44­5.Pokrovskaya MS, Sivakova OV, Meshkov AN, et al. Organization of biobanking of biological samples within the second stage of epidemiological study of cardiovascular risk factors and diseases in the regions of the Russian Federation (ESSERF2). Profilakticheskaya medicina. 2018;21(2­2):44­5. (In Russ.)Покровская М. С., Борисова А. Л., Кондрацкая В. А. и др. Подходы к автоматизации преаналитического этапа крупномасштабных научных исследований в биобанке ФГБУ "НМИЦ ТПМ" Минздрава России. Кардиоваскулярная терапия и профилактика. 2022;21(11):3404. doi:10.15829/1728­8800­2022­3404.Pokrovskaya MS, Borisova AL, Kondratskaya VA, et al. Approaches to automation of the preanalytical phase of large­ scale research in the biobank of the National Medical Research Center for Therapy and Preventive Medicine of the Ministry of Health of Russia. Cardiovascular Therapy and Prevention. 2022;21(11):3404. (In Russ.) doi:10.15829/1728­8800­2022­3404.Копылова О. В., Ершова А. И., Ефимова И. А. и др. Электронные истории болезни и биобанкирование. Кардиоваскулярная терапия и профилактика. 2022;21(11):3425. doi:10.15829/1728­8800­2022­3425.Kopylova OV, Ershova AI, Efimova IA, et al. Electronic medical records and biobanking. Cardiovascular Therapy and Prevention. 2022;21(11):3425. (In Russ.) doi:10.15829/1728­8800­2022­3425.Брызгалина Е. В., Глотов А. С. Этические аспекты работы биобанка. В кн.: Биобанкирование. Национальное руководство. Москва: ООО "Издательство ТРИУМФ", 2022. c. 132­153. ISBN 978­5­93673­322­2.Bryzgalina EV, Glotov AS. Ethical aspects of biobanking. In: Biobanking. National guidelines. Moscow: Triumph, 2022. p. 132153. (In Russ.) ISBN 978­5­93673­322­2.Bledsoe MJ. Ethical Legal and Social Issues of Biobanking: Past, Present, and Future. Biopreserv Biobank. 2017;15(2):142­7. doi:10.1089/bio.2017.0030.Bledsoe MJ. Ethical Legal and Social Issues of Biobanking: Past, Present, and Future. Biopreserv Biobank. 2017;15(2):142­7. doi:10.1089/bio.2017.0030.Покровская М. С., Кондрацкая В. А., Ефимова И. А. Особенности биобанкирования и контроля качества образцов биологических жидкостей. Кровь, сыворотка, плазма. В кн.: Биобанкирование. Национальное руководство. Москва: ООО "Издательство ТРИУМФ", 2022. С. 185­207. ISBN: 978­5­93673­322­2.Pokrovskaya MS, Kondratskaya VA, Efimova IA. Features of biobanking and quality control of biological fluid samples. Blood, serum, plasma. In: Biobanking. National guidelines. Moscow: Triumph, 2022. p. 185­207. (In Russ.) ISBN: 978­5­93673­322­2.Mooser V, Currat C. The Lausanne Institutional Biobank: a new resource to catalyse research in personalised medicine and pharmaceutical sciences. Swiss Med Wkly. 2014;4(144):w14033. doi:10.4414/smw.2014.14033.Mooser V, Currat C. The Lausanne Institutional Biobank: a new resource to catalyse research in personalised medicine and pharmaceutical sciences. Swiss Med Wkly. 2014;4(144):w14033. doi:10.4414/smw.2014.14033.Bernasconi L, Şen S, Angerame L, et al. Legal and ethical framework for global health information and biospecimen exchange — an international perspective. BMC Med Ethics. 2020;21(1):8. doi:10.1186/s12910­020­0448­9.Bernasconi L, Şen S, Angerame L, et al. Legal and ethical framework for global health information and biospecimen exchange — an international perspective. BMC Med Ethics. 2020;21(1):8. doi:10.1186/s12910­020­0448­9.Lecaros JA. Biobanks for Biomedical Research: Evolution and Future. In: Valdés E, Lecaros JA (eds). Handbook of Bioethical Decisions. 2023;Vol.I. Collaborative Bioethics, vol 2. Springer, Cham. doi:10.1007/978­3­031­29451­8_17.Lecaros JA. Biobanks for Biomedical Research: Evolution and Future. In: Valdés E, Lecaros JA (eds). Handbook of Bioethical Decisions. 2023;Vol.I. Collaborative Bioethics, vol 2. Springer, Cham. doi:10.1007/978­3­031­29451­8_17.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.