д.м.н., профессор, научный консультант.
Москва
Moscow
д.м.н., профессор, академик РАН, директор.
Москва
Moscow
Татьяна Валерьевна Соломай — к.м.н., с.н.с., лаборатория инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи.
Москва
Moscow
Несмотря на то, что банки данных геномных последовательностей имеют четкие информационные связи с биологическими образцами, они являются самостоятельным интеллектуальным ресурсом, востребованным у многих исследователей. Для депонирования информации, полученной в ходе молекулярно-генетических исследований в России, был сформирован банк данных VGARus (Virus Genome Aggregator of Russia).
Цель. Оценка данных о вариабельности генетических последовательностей вируса Эпштейна-Барр (ВЭБ), полученных в ходе отечественных исследований, и возможности их интеграции в банк данных VGARus для последующего использования в рамках эпидемиологического надзора.
Материал и методы. Осуществлен поиск научных публикаций в библиографических базах данных PubMed, eLibrary, Cyberleninka. Всего в исследование включено 32 работы отечественных и зарубежных авторов, отвечающих поставленной цели.
Результаты. Число исследований, содержащих данные о генетических последовательностях ВЭБ в Российской Федерации, крайне мало. Представленные в научных публикациях сведения указывают на территориальные различия в соотношении двух генотипов ВЭБ, наличие особенного варианта гена LMP1 TatK у татар Поволжья, отличие российских образцов ВЭБ по гену, кодирующему поверхностный гликопротеин gp350, от таковых из других регионов мира. При этом информация о геномных последовательностях, полученных в ходе проведенных исследований, ни в одном случае не была депонирована в российский генетический банк.
Заключение. Расширение возможностей отечественной платформы VGARus путем включения информации о геномных последовательностях всех циркулирующих на территории Российской Федерации патогенных для человека микроорганизмов потребует проведения масштабной работы, учитывающей технические особенности, требования биологической и информационной безопасности.
Despite the fact that databanks of genomic sequences have clear information links with biological samples, they are an independent intellectual resource in demand among many researchers. To deposit information obtained in the course of molecular genetic studies in Russia, the Virus Genome Aggregator of Russia (VGARus) databank was created.
Aim. To evaluate data on the variability of genetic sequences of the Epstein-Barr virus (EBV), obtained as a result of Russian studies, and the possibility of their integration into the VGARus database for
subsequent use in epidemiological surveillance.
Material and methods. A search for publications was carried out in the PubMed, eLibrary, Cyberleninka databases. In total, the study included 32 papers of Russian and external authors that meet the stated aim. Results. The number of studies containing data on the EBV genetic sequences in the Russian Federation is extremely small. The information presented in publications indicates geographical differences in the ratio of two EBV genotypes, the presence of a special LMP1 TatK gene variant in the Tatars of the Volga region, the difference between Russian EBV samples in the gene encoding the gp350 from those from other world regions. At the same time, information on the genomic sequences obtained in the studies was not deposited in the Russian gene bank in any case.
Conclusion. Expanding the potential of the Russian VGARus platform by including information on the genomic sequences of all pathogenic microorganisms circulating in the Russian Federation will require largescale work that takes into account technical features, biological and information security requirements.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.