cardiovascularКардиоваскулярная терапия и профилактикаCardiovascular Therapy and Prevention1728-88002619-0125«SILICEA-POLIGRAF» LLC10.15829/1728-8800-2024-4193KDQVRNcardiovascular-4193Research ArticleПРАКТИЧЕСКИЙ ОПЫТСтратегии создания биоресурсных коллекций в акушерстве: опыт Биобанка "Генофонд"Strategies for bioresource collection in obstetrics: the experience of the "Genofund" biobankhttps://orcid.org/0000-0003-4116-0222ПачулияО. В.PachuliaO. V.

Ольга Владимировна Пачулия — к.м.н., ученый секретарь.

Санкт-Петербург

Saint Petersburg

for.olga.kosyakova@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0003-2711-748XИлларионовР. А.IllarionovR. A.

Роман Арионович Илларионов — м.н.с. Биобанка "Генофонд" отдела геномной медицины им. В. С. Баранова, специалист РЦ "Центр Биобанк" Научного парка.

Санкт-Петербург

Saint Petersburg

r.a.illarionov@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0002-6996-8891ВашуковаЕ. СVashukovaE. S.

Елена Сергеевна Вашукова — к.б.н., н.с. лаборатории геномики отдела геномной медицины им. В. С. Баранова.

Санкт-Петербург

Saint Petersburg

vi_lena@list.ruhttps://orcid.org/0000-0002-8227-2629ПостниковаТ. Б.PostnikovaT. B.

Татьяна Борисовна Постникова — м.н.с. отдела акушерства и перинатологии.

Санкт-Петербург

Saint Petersburg

ptb20@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0002-5647-6783МальцеваА. Р.MaltsevaA. R.

Анастасия Романовна Мальцева — лаборант-исследователь Биобанка "Генофонд" отдела геномной медицины им. В. С. Баранова.

Санкт-Петербург

Saint Petersburg

nastya.chentsova@gmail.comhttps://orcid.org/0009-0008-3512-2557ПоповаА. К.PopovaA. K.

Анастасия Константиновна Попова — лаборант-исследователь лаборатории геномики отдела геномной медицины им. В. С. Баранова.

Санкт-Петербург

Saint Petersburg

stassi1997@mail.ruhttps://orcid.org/0009-0003-5918-2697КорнюшинаЕ. А.KornyushinaE. A.

Екатерина Амировна Корнюшина — к.м.н., с.н.с. акушерского отделения патологии беременности.

Санкт-Петербург

Saint Petersburg

hapacheva@yandex.ruhttps://orcid.org/0000-0002-6542-5953БеспаловаО. Н.BespalovaO. N.

Олеся Николаевна Беспалова — д.м.н., зам. директора по научной работе.

Санкт-Петербург

Saint Petersburg

shiggerra@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0002-7465-4504ГлотовА. С.GlotovA. S.

Андрей Сергеевич Глотов — д.б.н., зав. отдела геномной медицины им. В. С. Баранова, профессор кафедры генетики и биотехнологии.

Санкт-Петербург

Saint Petersburg

anglotov@mail.ruФГБНУ "Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта"Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology and ReproductologФГБНУ "Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта"; ФГБОУ ВО "Санкт-Петербургский государственный университет"Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology and Reproductolog; Saint Petersburg State University2024301220242311Биобанкирование41934193Copyright © Пачулия О.В., Илларионов Р.А., Вашукова Е.С., Постникова Т.Б., Мальцева А.Р., Попова А.К., Корнюшина Е.А., Беспалова О.Н., Глотов А.С., 20252025Пачулия О.В., Илларионов Р.А., Вашукова Е.С., Постникова Т.Б., Мальцева А.Р., Попова А.К., Корнюшина Е.А., Беспалова О.Н., Глотов А.С.Pachulia O.V., Illarionov R.A., Vashukova E.S., Postnikova T.B., Maltseva A.R., Popova A.K., Kornyushina E.A., Bespalova O.N., Glotov A.S.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://cardiovascular.elpub.ru/jour/article/view/4193

В статье освещен опыт Биобанка "Генофонд" ФГБНУ "НИИ АГиР им. Д. О. Отта" по созданию биоресурных коллекций, представляющих стратегическое научное и практическое значение в области современного акушерства. Для создания различных типов коллекций впервые были сформулированы принципиально различающиеся стратегии биобанкирования образцов: "единовременное" и "лонгитюдное" (динамическое). Даны определения данным подходам, отмечены наиболее значимые преимущества и недостатки каждого из них. Приведены примеры пилотных исследований, проведенных на платформе биоресурсной коллекции, созданной с применением наиболее сложного подхода — "лонгитюдного" биобанкирования. Такой подход позволил на примере анализа микроРНК продемонстрировать возможности изучения закономерностей физиологических изменений при беременности на современном этапе, а также перспективы поиска ранних предикторов осложнений беременности.

The article highlights the experience of the "Genofund" biobank of the Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology and Reproductology in bioresource collection in modern obstetrics. To create different types of collections, the following different biobanking strategies were formulated for the first time: cross-sectional and longitudinal (dynamic). Definitions are given for these approaches. The most significant advantages and disadvantages of each of them are noted. Examples of pilot studies conducted on the platform of a bioresource collection created using the complex longitudinal biobanking are given. This approach made it possible to demonstrate, using the example of microRNA analysis, the potential of studying the physiological changes during pregnancy at the present stage, as well as the prospects for finding early predictors of pregnancy complications.

биоресурсные коллекции"лонгитюдное" банкирование"единовременное" банкированиебеременностьфизиология беременностипредикторы осложнений гестацииbioresource collectionslongitudinal bankingcross-sectional bankingpregnancypregnancy physiologypregnancy complicationsИсследование поддержано грантом РНФ 197520033-ПThe study was supported by the grant of the Russian Science Foundation 197520033-PReferencesTan EK, Tan EL. Alterations in physiology and anatomy during pregnancy. Best Pract Res Clin Obstet Gynaecol. 2013;27(6): 791-802. doi:10.1016/j.bpobgyn.2013.08.001.Tan EK, Tan EL. Alterations in physiology and anatomy during pregnancy. Best Pract Res Clin Obstet Gynaecol. 2013;27(6): 791-802. doi:10.1016/j.bpobgyn.2013.08.001.Schreiber K, Graversgaard C, Hunt BJ, et al. Challenges of designing and conducting cohort studies and clinical trials in populations of pregnant people. Lancet Rheumatol. 2024;6(8): e560-72. doi:10.1016/S2665-9913(24)00118-8.Schreiber K, Graversgaard C, Hunt BJ, et al. Challenges of designing and conducting cohort studies and clinical trials in populations of pregnant people. Lancet Rheumatol. 2024;6(8): e560-72. doi:10.1016/S2665-9913(24)00118-8.Gomez-Lopez N, Romero R, Hassan SS, et al. The Cellular Transcriptome in the Maternal Circulation During Normal Pregnancy: A Longitudinal Study. Front Immunol. 2019;10:2863. doi:10.3389/ fimmu.2019.02863.Gomez-Lopez N, Romero R, Hassan SS, et al. The Cellular Transcriptome in the Maternal Circulation During Normal Pregnancy: A Longitudinal Study. Front Immunol. 2019;10:2863. doi:10.3389/ fimmu.2019.02863.Chen J, Tian R, Zou Z, et al. Longitudinal study of multidimensional factors influencing maternal and offspring health outcomes: a study protocol. BMC Pregnancy Childbirth. 2023;23(1):466. doi:10.1186/s12884-023-05785-1.Chen J, Tian R, Zou Z, et al. Longitudinal study of multidimensional factors influencing maternal and offspring health outcomes: a study protocol. BMC Pregnancy Childbirth. 2023;23(1):466. doi:10.1186/s12884-023-05785-1.Mavreli D, Theodora M, Kolialexi A. Known biomarkers for monitoring pregnancy complications. Expert Rev Mol Diagn. 2021; 21(11):1115-7. doi:10.1080/14737159.2021.1971078.Mavreli D, Theodora M, Kolialexi A. Known biomarkers for monitoring pregnancy complications. Expert Rev Mol Diagn. 2021; 21(11):1115-7. doi:10.1080/14737159.2021.1971078.Lin W, Teng S-W, Lin T-Y, et al. Combinatorial Analysis of Circulating Biomarkers and Maternal Characteristics for Preeclampsia Prediction in the First and Third Trimesters in Asia. Diagnostics. 2022;12(7):1533. doi:10.3390/diagnostics12071533.Lin W, Teng S-W, Lin T-Y, et al. Combinatorial Analysis of Circulating Biomarkers and Maternal Characteristics for Preeclampsia Prediction in the First and Third Trimesters in Asia. Diagnostics. 2022;12(7):1533. doi:10.3390/diagnostics12071533.Liu Y, Li DY, Bolatai A, Wu N. Progress in Research on Biomarkers of Gestational Diabetes Mellitus and Preeclampsia. Diabetes Metab Syndr Obes. 2023;16:3807-15. doi:10.2147/DMSO.S433179.Liu Y, Li DY, Bolatai A, Wu N. Progress in Research on Biomarkers of Gestational Diabetes Mellitus and Preeclampsia. Diabetes Metab Syndr Obes. 2023;16:3807-15. doi:10.2147/DMSO.S433179.Мальцева А. Р., Илларионов Р. А., Вашукова Е. С. и др. Инвентаризация и контроль качества "Коллекции биообразцов от беременных женщин на разных сроках гестации для поиска ранних биомаркеров осложнений беременности". Кардиоваскулярная терапия и профилактика. 2023;22(11):3740. doi:10.15829/1728-8800-2023-3740.Maltseva AR, Illarionov RA, Vashukova ES, et al. Inventory and quality control of biosample collection from pregnant women at different gestational ages to search for early biomarkers of pregnancy complications. Cardiovascular Therapy and Prevention. 2023;22(11):3740. (In Russ.) doi:10.15829/1728-8800-2023-3740.Vashukova ES, Kozyulina PY, Illarionov RA, et al. High-Throughput Sequencing of Circulating MicroRNAs in Plasma and Serum during Pregnancy Progression. Life (Basel). 2021;11(10):1055. doi:10.3390/life11101055.Vashukova ES, Kozyulina PY, Illarionov RA, et al. High-Throughput Sequencing of Circulating MicroRNAs in Plasma and Serum during Pregnancy Progression. Life (Basel). 2021;11(10):1055. doi:10.3390/life11101055.Illarionov RA, Pachuliia OV, Vashukova ES, et al. Plasma miRNA Profile in High Risk of Preterm Birth during Early and Mid-Pregnancy. Genes (Basel). 2022;13(11):2018. doi:10.3390/genes13112018.Illarionov RA, Pachuliia OV, Vashukova ES, et al. Plasma miRNA Profile in High Risk of Preterm Birth during Early and Mid-Pregnancy. Genes (Basel). 2022;13(11):2018. doi:10.3390/genes13112018.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.