д.б.н., профессор, зав. лабораторией популяционной генетики человека.
Москворечье, д. 1, Москва, 115478
Moskvorechye, 1, Moscow, 115478
Лаборант-исследователь.
Москворечье, д. 1, Москва, 115478
Moskvorechye, 1, Moscow, 115478
н.с.
Москворечье, д. 1, Москва, 115478
Moskvorechye, 1, Moscow, 115478
н.с.
Москворечье, д. 1, Москва, 115478
Moskvorechye, 1, Moscow, 115478
н.с., руководитель лаборатории "Банк биологического материала" Института персонализированной терапии и профилактики.
Петроверигский пер., 10, Москва, 101990
Petroverigsky Lane, 10, Moscow, 101990
к.б.н., в.н.с. лаборатории "Банк биологического материала" Института персонализированной терапии и профилактики.
Петроверигский пер., 10, Москва, 101990
Petroverigsky Lane, 10, Moscow, 101990
к.г.н., в.н.с. географического факультета.
Ленинские горы, д. 1, Москва, 119991
Leninskiye Gory, 1, Moscow, 119991
д.м.н., доцент, зав. кафедрой биологии и медицинских технологий.
Москворечье, д. 1, Москва, 115478; ул. им. Митрофана Седина, д. 4, Краснодар, 350063
Moskvorechye, 1, Moscow, 115478; Mitrofana Sedina str., 4, Krasnodar, 350063
к.ф.- м.н., с.н.с.
Москворечье, д. 1, Москва, 115478
Moskvorechye, 1, Moscow, 115478
Цель. Изучить геногеографию SNP-маркеров, связанных с тяжелым течением COVID-19 (COrona VIrus Disease 2019), и выявить закономерности их распределения в коренном народонаселении России и мира. Частота генетических полиморфизмов, ассоциированных с осложнениями при COVID-19, неодинакова в разных этнических группах.
Материал и методы. На основе коллекций Биобанка ФГБУ "НМИЦ ТПМ" Минздрава России и Биобанка Северной Евразии определены частоты аллелей и генотипов генов NFKBIA, TLR3, TMPRSS2, ассоциированных с осложнениями при COVID-19. В анализ включены собственные данные (4207 образцов 186 популяций 97 этносов из России и сопредельных стран) и данные из публикаций (3070 образцов из 227 популяций мира). Данные изучены биоинформатическими, статистическими и картографическими методами.
Результаты. Выявлена высокая частота "рисковой" гомозиготы GG маркера NFKBIA (rs696) в популяциях России (0,55) с трендом ее роста с запада на восток в максимально широком диапазоне: от 0,08 у ижоры на северо-западе до 0,92 у эвенов Дальнего Востока. Для населения России характерны высокие значения частот альтернативных гомозигот полиморфизмов TLR3 (rs3775291) и TMPRSS2 (rs2070788), не связанных с риском осложнений при COVID-19. Коренное народонаселение Северной Евразии отличается наибольшим генетическим разнообразием среди всех регионов мира. При этом оно гармонично вписано в генофонд Евразийского континента, а Дальний Восток России является переходной зоной к генофонду коренного населения Северной Америки.
Заключение. Исследование геногеографической изменчивости позволяет выявить регионы России и мира, для которых анализируемые ДНК-маркеры в наибольшей степени являются рисковыми при тяжелом течении COVID-19.
Aim. To study the genogeography of SNP markers associated with severe coronavirus disease 2019 (COVID-19) and identify patterns of their distribution in indigenous populations of Russia and worldwide. The frequency of genetic polymorphisms associated with COVID-19 complications varies across ethnic groups.
Material and methods. Using collections from the Biobank of the National Medical Research Center for Therapy and Preventive Medicine and the Biobank of Northern Eurasia, we determined the allele and genotype frequencies of the NFKBIA, TLR3, and TMPRSS2 genes associated with COVID-19 complications. The analysis included our own data (4207 samples from 186 populations of 97 ethnic groups from Russia and neighboring countries) and published data (3070 samples from 227 populations worldwide). The data were analyzed using bioinformatics, statistical, and cartographic methods.
Results. A high frequency of the "risky" GG homozygote of the NFKBIA marker (rs696) was detected in Russian populations (0,55), with an increasing trend from west to east across the widest range as follows: from 0,08 among the Izhorians in the northwest to 0,92 among the Evens in the Far East. The Russian population is characterized by high frequencies of alternative homozygotes of the TLR3 (rs3775291) and TMPRSS2 (rs2070788) polymorphisms, which are not associated with the risk of COVID-19 complications. The indigenous populations of Northern Eurasia possess the greatest genetic diversity of any region in the world. At the same time, they are harmoniously integrated into the gene pool of the Eurasian continent, and the Russian Far East is a transition zone to the gene pool of the indigenous populations of North America.
Conclusion. A study of genogeographic variation makes it possible us to identify regions of Russia and the world for which the analyzed DNA markers pose the greatest risk for severe COVID-19.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.