cardiovascularКардиоваскулярная терапия и профилактикаCardiovascular Therapy and Prevention1728-88002619-0125«SILICEA-POLIGRAF» LLC10.15829/1728-8800-2026-4633LTGQJNcardiovascular-4633Research ArticleБИОБАНКИРОВАНИЕBIOBANKINGОпыт создания коллекции культур микроорганизмов и биологических образцов референс-центра ФГБУ "НМИЦ колопроктологии им. А. Н. Рыжих" Минздрава РоссииExperience in creating a collection of microbial cultures and biological specimens at the reference center of the A. N. Ryzhikh National Medical Research Center of Coloproctology of the Ministry of Health of the Russian Federationhttps://orcid.org/0000-0002-5494-415XМелкумянА. Р.MelkumyanA. R.

к.м.н., руководитель референс-центра

Москва

Moscow

alinamelkumyan@yandex.ruhttps://orcid.org/0009-0009-8798-5917СпивакМ. В.SpivakM. V.

специалист референс-центра

Москва

Moscow

spivak_mv@gnck.ruhttps://orcid.org/0009-0000-8669-1014ШафиковаА. А.ShafikovaA. A.

ведущий специалист референс-центра

Москва

Moscow

shafikova_aa@gnck.ruhttps://orcid.org/0000-0001-9294-5447АчкасовС. И.AchkasovS. I.

д.м.н., профессор, член-корр. РАН, директор

Москва

Moscow

info@gnck.ruФГБУ "Национальный медицинский исследовательский центр колопроктологии им. А. Н. Рыжих" Минздрава РоссииРоссияA. N. Ryzhikh National Medical Research Center of ColoproctologyRussian Federation20262202202625146334633Copyright © Мелкумян А.Р., Спивак М.В., Шафикова А.А., Ачкасов С.И., 20262026Мелкумян А.Р., Спивак М.В., Шафикова А.А., Ачкасов С.И.Melkumyan A.R., Spivak M.V., Shafikova A.A., Achkasov S.I.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://cardiovascular.elpub.ru/jour/article/view/4633

В статье рассматриваются ключевые аспекты структурной организации и функционирования биобанка, включая основные этапы процессинга биологических образцов. Особое внимание уделено реализации научных проектов с использованием консервированного биологического материала и коллекций штаммов микроорганизмов. Описаны принципы формирования коллекции штаммов микроорганизмов и биологического материала в криобанке, как подразделении референс-центра по верификации результатов микробиологических исследований по профилю "колопроктология", созданного на базе ФГБУ "НМИЦ колопроктологии им. А. Н. Рыжих" Минздрава России. Представлен опыт взаимодействия референс-центра с медицинскими организациями субъектов Российской Федерации в рамках системы мониторинга биологических рисков. Описана система криобанкирования образцов по приоритетным направлениям биомедицинских исследований. Полученные результаты демонстрируют значимость интегрированного подхода к биобанкированию в целях повышения эффективности научных и клинических разработок.

This article examines key aspects of the structural organization and functioning of a biobank, including the main stages of biological sample processing. Particular attention is paid to the implementation of research projects using preserved biological material and microbial strain collections. The article describes collection of microorganism strains and biological material in a cryobank, a division of the reference center for the verification of microbiological research results in coloproctology, established at the A. N. Ryzhikh National Medical Research Center of Coloproctology. This article presents the experience of a reference center collaborating with medical facilities in Russian regions within the biological risk monitoring system. A cryobanking system for samples in priority areas of biomedical research is described. The obtained results demonstrate the importance of an integrated approach to biobanking for improving the effectiveness of scientific and clinical developments.

криоконсервацияантибиотикорезистентностьвоспалительные заболевания кишечникаанаэробные инфекцииcryopreservationantibiotic resistanceinflammatory bowel diseaseanaerobic infectionsReferencesRyan MJ, Schloter M, Berg G, et al. Development of microbiome biobanks — challenges and opportunities. Trends Microbiol. 2021; 29(2):89-92. doi:10.1016/j.tim.2021.01.009.Ryan MJ, Schloter M, Berg G, et al. Development of microbiome biobanks — challenges and opportunities. Trends Microbiol. 2021; 29(2):89-92. doi:10.1016/j.tim.2021.01.009.Кособокова Е. Н., Калинина Н. А., Барышникова М. А. и др. Биоресурсные коллекции: алгоритмы формирования и функционирования, фундаментальная и прикладная значимость. Кардиоваскулярная терапия и профилактика. 2023;22(11):3654. doi:10.15829/1728-8800-2023-3654.Kosobokova EN, Kalinina NA, Baryshnikova MA, et al. Bioresource collections: algorithms for development and functioning; basic and applied significance. Cardiovascular Therapy and Prevention. 2023;22(11):3654. (In Russ.) doi:10.15829/1728-8800-2023-3654.Jaroszewska E, Nasiłowska J, Sokolowska B. Microbial Culture Collections and Microbiological Biobanks in the Context of New ISO Standards. Adv Microbiol. 2023;62(1):55-60. doi: 10.2478/am-2023-0005.Jaroszewska E, Nasiłowska J, Sokolowska B. Microbial Culture Collections and Microbiological Biobanks in the Context of New ISO Standards. Adv Microbiol. 2023;62(1):55-60. doi: 10.2478/am-2023-0005.Онищенко Г. Г., Кутырев В. В., Осин А. В. Коллекционная деятельность в области использования патогенных микроорганизмов в обеспечении биологической безопасности Российской Федерации. Инфекционные болезни: Новости. Мнения. Обучение. 2016;(1): 37-46.Onishchenko GG, Kutyrev VV, Osin AV. Collection activities in the sphere of pathogenic microorganisms usage for the provision of biological safety in the Russian Federation. Infekcionnye bolezni: Novosti. Mnenija. Obuchenie. 2016;(1):37-46. (In Russ.)Грачева И. В., Осин А. В., Кутырев В. В. Принципы формирования коллекционных фондов штаммов микроорганизмов. Проблемы особо опасных инфек- ций. 2021;2:16-23. doi:10.21055/0370-1069-2021-2-16-23.Gracheva IV, Osin AV, Kutyrev VV. Principles of Formation of Collection Funds of Microorganism Strains. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2021;2:16-23. (In Russ.) doi:10.21055/0370-1069-2021-2-16-23.Kinkorova J. Biobanks in the era of personalized medicine: objectives, challenges, and innovation: overview. EPMA J. 2016;7(1):4. doi:10.1186/s13167-016-0053-7.Kinkorova J. Biobanks in the era of personalized medicine: objectives, challenges, and innovation: overview. EPMA J. 2016;7(1):4. doi:10.1186/s13167-016-0053-7.Rush A, Catchpoole DR, Reaiche-Miller G, et al. What do biomedical researchers want from biobanks? Results of an online survey. Biopreserv Biobank. 2022;20(3):271-82. doi:10.1089/bio.2021.0084.Rush A, Catchpoole DR, Reaiche-Miller G, et al. What do biomedical researchers want from biobanks? Results of an online survey. Biopreserv Biobank. 2022;20(3):271-82. doi:10.1089/bio.2021.0084.Vaught J. Biobanking comes of age: the transition to biospecimen science. Ann Rev Pharmacol Toxicol. 2016;56(1):211-28. doi:10. 1146/annurev-pharmtox-010715-103246.Vaught J. Biobanking comes of age: the transition to biospecimen science. Ann Rev Pharmacol Toxicol. 2016;56(1):211-28. doi:10.1146/annurev-pharmtox-010715-103246.Lianos GD, Frountzas M, Kyrochristou ID, et al. What Is the Role of the Gut Microbiota in Anastomotic Leakage After Colorectal Resection? A Scoping Review of Clinical and Experimental Studies. J Clin Med. 2024;13(22):6634. doi:10.3390/jcm13226634.Lianos GD, Frountzas M, Kyrochristou ID, et al. What Is the Role of the Gut Microbiota in Anastomotic Leakage After Colorectal Resection? A Scoping Review of Clinical and Experimental Studies. J Clin Med. 2024;13(22):6634. doi:10.3390/jcm13226634.Khan A, Kim S, Hong ST. Gut Microbes Libraries: A Key Resource for Current Gut Microbiome Research. J Bacteriol Virol. 2025; 55(1):1-9. doi:10.4167/jbv.2025.55.1.001.Khan A, Kim S, Hong ST. Gut Microbes Libraries: A Key Resource for Current Gut Microbiome Research. J Bacteriol Virol. 2025; 55(1):1-9. doi:10.4167/jbv.2025.55.1.001.Zika E, Paci D, Braun A, et al. A European survey on biobanks: trends and issues. Public Health Genomics. 2011;14(2):96-103. doi:10.1159/000296278.Zika E, Paci D, Braun A, et al. A European survey on biobanks: trends and issues. Public Health Genomics. 2011;14(2):96-103. doi:10.1159/000296278.Qiu Y, Fan D, Wang J, et al. High throughput construction of species characterized bacterial biobank for functional bacteria screening: demonstration with GABA-producing bacteria. Front Microbiol. 2025;16:1545877. doi:10.3389/fmicb.2025.1545877.Qiu Y, Fan D, Wang J, et al. High throughput construction of species characterized bacterial biobank for functional bacteria screening: demonstration with GABA-producing bacteria. Front Microbiol. 2025;16:1545877. doi:10.3389/fmicb.2025.1545877.Mouttham L, Garrison SJ, Archer DL, et al. A biobank's journey: Implementation of a quality management system and accreditation to ISO 20387. Biopreserv Biobank. 2021;19(3):163-70. doi:10.1089/bio.2020.0068.Mouttham L, Garrison SJ, Archer DL, et al. A biobank's journey: Implementation of a quality management system and accreditation to ISO 20387. Biopreserv Biobank. 2021;19(3):163-70. doi:10.1089/bio.2020.0068.Wittner R, Holub P, Mascia C, et al. Towards a Common Standard for Data and Specimen Provenance in Life Sciences. Learn Health Syst. 2023;18;8(1):e10365. doi:10.1002/lrh2.10365.Wittner R, Holub P, Mascia C, et al. Towards a Common Standard for Data and Specimen Provenance in Life Sciences. Learn Health Syst. 2023;18;8(1):e10365. doi:10.1002/lrh2.10365.Clavel T, Faber F, Groussin M, et al. Enabling next-generation anaerobic cultivation through biotechnology to advance functional microbiome research. Nat Biotechnol. 2025;1-11. doi:10.1038/s41587-025-02660-6.Clavel T, Faber F, Groussin M, et al. Enabling next-generation anaerobic cultivation through biotechnology to advance functional microbiome research. Nat Biotechnol. 2025;1-11. doi:10.1038/s41587-025-02660-6.Dagher G. Quality matters: International standards for biobanking. Cell Prolif. 2022;55(8):e13282. doi:10.1111/cpr.13282.Dagher G. Quality matters: International standards for biobanking. Cell Prolif. 2022;55(8):e13282. doi:10.1111/cpr.13282.Lewandowska I, Grzech K, Krzyszton-Russjan J. Importance of Human Faecal Biobanking: From Collection to Storage. Adv Microbiol. 2024;63(4):181-9. doi:10.2478/am-2024-0015.Lewandowska I, Grzech K, Krzyszton-Russjan J. Importance of Human Faecal Biobanking: From Collection to Storage. Adv Microbiol. 2024;63(4):181-9. doi:10.2478/am-2024-0015.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.