<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">cardiovascular</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Кардиоваскулярная терапия и профилактика</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Cardiovascular Therapy and Prevention</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">1728-8800</issn><issn pub-type="epub">2619-0125</issn><publisher><publisher-name>«SILICEA-POLIGRAF» LLC</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.15829/1728-8800-2023-3711</article-id><article-id custom-type="edn" pub-id-type="custom">UOWPDT</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">cardiovascular-3711</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>БИОБАНКИРОВАНИЕ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>BIOBANKING</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Исследование особенностей метаболома пациентов с COVID-19</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Study of the metabolome features of patients with COVID-19</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-1762-3055</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Русских</surname><given-names>Я. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Russkikh</surname><given-names>Y. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Яна Владимировна Русских — кандидат химических наук, специалист.</p><p>Сестрорецк</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Sestroretsk</p></bio><email xlink:type="simple">YANARUSSK@GMAIL.COM</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-5100-5229</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Сушенцева</surname><given-names>Н. Н.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Sushentseva</surname><given-names>N. N.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Наталья Николаевна Сушенцева — начальник научно- исследовательской лаборатории трансляционной биомедицины научно- исследовательского отдела инновационных и конверсионных программ.</p><p>Сестрорецк</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Sestroretsk</p></bio><email xlink:type="simple">navicula@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-1778-0165</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Попов</surname><given-names>О. С.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Popov</surname><given-names>O. S.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Олег Сергеевич Попов — специалист, магистрант.</p><p>Сестрорецк, Санкт- Петербург</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Sestroretsk</p></bio><email xlink:type="simple">ospopov@outlook.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-3853-4185</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Апалько</surname><given-names>С. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Apalko</surname><given-names>S. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Светлана Вячеславовна Апалько — кандидат биологических наук, начальник научно- исследовательского отдела инновационных и конверсионных программ, старший научный сотрудник.</p><p>Сестрорецк, Санкт- Петербург</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Sestroretsk</p></bio><email xlink:type="simple">svetlana.apalko@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-5642-621X</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Анисенкова</surname><given-names>А. Ю.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Anisenkova</surname><given-names>A. Yu.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Анна Юрьевна Анисенкова — врач-терапевт, кардиолог, доцент кафедры последипломного медицинского образования.</p><p>Сестрорецк, Санкт- Петербург</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Sestroretsk</p></bio><email xlink:type="simple">anna_anisenkova@list.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-1357-4324</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Мосенко</surname><given-names>С. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Mosenko</surname><given-names>S. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Сергей Викторович Мосенко — врач-невролог, старший научный сотрудник.</p><p>Сестрорецк, Санкт- Петербург</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Sestroretsk</p></bio><email xlink:type="simple">neurologist@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-3198-8990</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Сарана</surname><given-names>А. М.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Sarana</surname><given-names>A. M.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Андрей Михайлович Сарана — доцент кафедры последипломного мед. образования, и.о. декана медицинского факультета, первый заместитель председателя Комитета по здравоохранению Правительства Санкт-Петербурга.</p><p>Санкт- Петербург</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Sestroretsk</p></bio><email xlink:type="simple">asarana@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-3"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-5047-2792</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Щербак</surname><given-names>С. Г.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Shcherbak</surname><given-names>S. G.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Сергей Григорьевич Щербак — главный врач, профессор кафедры последипломного медицинского образования, заведующий кафедрой.</p><p>Сестрорецк, Санкт- Петербург</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Sestroretsk</p></bio><email xlink:type="simple">sgsherbak@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru">СПбГБУЗ "Городская больница № 40 Курортного района" Отдела здравоохранения Администрации Курортного района   г. Санкт-Петербурга<country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en">City Hospital № 40 of the Kurortny District<country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-2"><aff xml:lang="ru">СПбГБУЗ "Городская больница № 40 Курортного района" Отдела здравоохранения Администрации Курортного района   г. Санкт-Петербурга; ФГБОУ ВО "Санкт- Петербургский государственный университет"<country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en">City Hospital № 40 of the Kurortny District; Saint­ Petersburg State University<country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-3"><aff xml:lang="ru">ФГБОУ ВО "Санкт- Петербургский государственный университет"; Комитет по здравоохранению Санкт-Петербурга<country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en">Saint­Petersburg State University; Health Committee of Saint­Petersburg<country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2023</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>10</day><month>12</month><year>2023</year></pub-date><volume>22</volume><issue>11</issue><issue-title>Биобанкирование</issue-title><fpage>3711</fpage><lpage>3711</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Русских Я.В., Сушенцева Н.Н., Попов О.С., Апалько С.В., Анисенкова А.Ю., Мосенко С.В., Сарана А.М., Щербак С.Г., 2023</copyright-statement><copyright-year>2023</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Русских Я.В., Сушенцева Н.Н., Попов О.С., Апалько С.В., Анисенкова А.Ю., Мосенко С.В., Сарана А.М., Щербак С.Г.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Russkikh Y.V., Sushentseva N.N., Popov O.S., Apalko S.V., Anisenkova A.Y., Mosenko S.V., Sarana A.M., Shcherbak S.G.</copyright-holder><license license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://cardiovascular.elpub.ru/jour/article/view/3711">https://cardiovascular.elpub.ru/jour/article/view/3711</self-uri><abstract><sec><title>Цель</title><p>Цель. Комплексный анализ особенностей метаболомного профиля пациентов с COVID-19 (COrona VIrus Disease 2019, новая коронавирусная инфекция) с использованием методов массспектрометрии и с учетом клинико-лабораторного анамнеза. Изучение связи между тяжестью симптомов COVID-19 и концентрацией первичных метаболитов, прежде всего аминокислот.</p></sec><sec><title>Материал и методы</title><p>Материал и методы. В ретроспективное исследование включены образцы сыворотки крови в общей сложности 935 человек (445 мужчин и 490 женщин) из коллекции биобанка СПб ГБУЗ "Городская больница № 40" из числа заболевших COVID-19. Во всех образцах хромато-масс-спектрометрическим методом было проведено исследование метаболомного профиля. Для статистической обработки данных использовался язык программирования R.</p></sec><sec><title>Результаты</title><p>Результаты. На основании проведенного анализа выявлено различие метаболического профиля пациентов с COVID-19 в зависимости от тяжести заболевания — для 52 из 84 обнаруженных соединений наблюдались различия с достоверностью p&lt;0,01. Статистически значимые различия в концентрации зафиксированы для органических кислот, аминокислот и их производных.</p></sec><sec><title>Заключение</title><p>Заключение. С использованием образцов из коллекции биобанка было проведено метаболомное исследование биоматериала пациентов, госпитализированных с диагнозом COVID-19. Согласно полученным результатам, с тяжестью протекания COVID-19 ассоциированы кинуренин, фенилаланин и ацетилкарнитин. Выявлены различия метаболомного профиля у пациентов с цитокиновым штормом на момент взятия крови, определены метаболиты, подходящие под потенциальные биомаркеры развития цитокинового шторма.</p></sec></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><sec><title>Aim</title><p>Aim. To analyze the metabolomic profile of patients with coronavirus disease 2019 (COVID-19) using mass spectrometry methods and taking into account clinical and laboratory history. Studying the relationship between the severity of COVID-19 symptoms and the concentration of primary metabolites, primarily amino acids.</p></sec><sec><title>Material and methods</title><p>Material and methods. The retrospective study included serum samples from a total of 935 people (445 men and 490 women) with COVID-19 from the collection of the biobank of the City Hospital № 40. A metabolomic profile was studied in all samples using chromatography-mass spectrometry. The R language was used for statistical data processing.</p></sec><sec><title>Results</title><p>Results. Based on the analysis, a difference in the metabolic profile of patients with COVID-19 was identified depending on the disease severity — for 52 of the 84 detected compounds, differences were observed with a significance of p&lt;0,01. Significant differences in concentration were recorded for organic acids, amino acids and their derivatives.</p></sec><sec><title>Conclusion</title><p>Conclusion. Using samples from the biobank collection, a metabolomic study of the biomaterial of patients hospitalized with a diagnosis of COVID-19 was carried out. According to the results obtained, kynurenine, phenylalanine and acetylcarnitine are associated with COVID-19 severity. Differences in the metabolomic profile were identified in patients with cytokine storm at the time of blood collection. Potential biomarkers for cytokine storm were identified.</p></sec></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>биобанк</kwd><kwd>COVID-19</kwd><kwd>метаболомный профиль</kwd><kwd>хромато-масс-спектрометрический анализ</kwd><kwd>цитокиновый шторм</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>biobank</kwd><kwd>COVID-19</kwd><kwd>metabolomic profile</kwd><kwd>gas chromatography-mass spectrometry analysis</kwd><kwd>cytokine storm</kwd></kwd-group></article-meta></front><body><sec><title>Введение</title><p>В последнее время появляется все больше исследований, посвященных анализу метаболома крови для диагностики и оценки тяжести заболеваний [1-4]. Метаболомное профилирование биологических жидкостей человека вызывает большой интерес с точки зрения возможностей получения дополнительных знаний о патогенезе заболеваний и возможных терапевтических мишенях.</p><p>Основным методом исследования метаболома является масс-спектрометрия (МС), которая позволяет с высокой надежностью, специфичностью и чувствительностью определять широкий круг разнообразных соединений, в т.ч. являющихся маркерами заболеваний, даже в очень низкой концентрации.</p><p>Биобанки предоставляют исследователям охарактеризованный биологический материал, что позволяет сформировать оптимальные когорты пациентов. Использование биобанков дает возможность проводить масштабные метаболомные исследования в сжатые сроки и быстро внедрять значимые результаты в клиническую практику.</p><p>Сочетание возможностей МС и биобанкирования в метаболомном анализе может использоваться для оценки прогноза развития новой коронавирусной инфекции, а выявленные метаболические профили — для уточнения связанных с заболеванием биологических путей.</p><p>Известно, что новая коронавирусная инфекция 2019 (COVID-19 — COrona VIrus Disease 2019) вызывает у некоторых инфицированных людей продолжительный и неконтролируемый цитокиновый ответ, известный как цитокиновый шторм (ЦШ). ЦШ при COVID-19 часто приводит к диффузному альвеолярному повреждению легких, проявляющемуся острым респираторным дистресс-синдромом с явлениями полиорганной недостаточности, а в ряде случаев тромбогеморрагическим (ДВС-подобным) синдромом, или синдромом диссеминированного внутрисосудистого свертывания крови, и может стать причиной летального исхода [<xref ref-type="bibr" rid="cit1">1</xref>][<xref ref-type="bibr" rid="cit5">5</xref>].</p><p>Выявление факторов, позволяющих прогнозировать риск развития тяжелого течения заболевания и его осложнений, а также поиск биомаркеров, определяющих риски развития ЦШ при COVID-19, является важной задачей.</p><p>Спектр аминокислот отображает многие процессы, происходящие в организме, и может содержать сведения об особенностях протекании многих заболеваний. Аминокислоты необходимы для синтеза белков, гормонов и нейротрансмиттеров, они являются предшественниками многих жизненно важных молекул и играют ключевую роль в функционировании иммунных клеток, поэтому нарушение метаболизма аминокислот может вызывать неврологические симптомы и полиорганную недостаточность [<xref ref-type="bibr" rid="cit6">6</xref>][<xref ref-type="bibr" rid="cit7">7</xref>]. Аминокислоты плазмы связывают все системы органов и играют важную физиологическую роль в качестве основных метаболитов и регуляторов метаболизма. Соответственно, метаболические изменения, возникающие при заболеваниях различных систем и органов, будут оказывать влияние на аминокислотные профили, а спектр аминокислот может служить прогностическим фактором или указывать на развитие ряда заболеваний [<xref ref-type="bibr" rid="cit8">8</xref>].</p><p>К настоящему времени опубликовано немало работ, посвященных изучению метаболомного профиля пациентов с COVID-19. Большинство из них направлены на определение уникальной метаболической сигнатуры COVID-19 или на прогнозирование тяжести заболевания и/или смертности от него [1-3][<xref ref-type="bibr" rid="cit9">9</xref>]. Отмечено, что при многих заболеваниях изменение уровня определенных аминокислот может служить прогностическим фактором [<xref ref-type="bibr" rid="cit4">4</xref>][<xref ref-type="bibr" rid="cit6">6</xref>]. Кроме того, в ряде клинических исследований было показано, что на исход заболевания может влиять добавка в рацион аминокислот, концентрация которых уменьшается при тяжелом течении COVID-19 [<xref ref-type="bibr" rid="cit1">1</xref>][<xref ref-type="bibr" rid="cit2">2</xref>]. Таким образом, выявление аминокислотных профилей может быть полезным не только в качестве биомаркеров патологических состояний, но и для разработки стратегий лечения [<xref ref-type="bibr" rid="cit3">3</xref>][<xref ref-type="bibr" rid="cit4">4</xref>].</p><p>Концентрации аминокислот в сыворотке крови достаточно сильно связаны с симптоматикой COVID-19 [<xref ref-type="bibr" rid="cit1">1</xref>][<xref ref-type="bibr" rid="cit6">6</xref>][9-12]. Однако данные об участии отдельных аминокислот в патологических процессах могут значительно расходиться. Так, в ряде исследований сообщалось, что уровень концентрации фенилаланина был положительно связан с тяжестью симптомов [<xref ref-type="bibr" rid="cit6">6</xref>][<xref ref-type="bibr" rid="cit13">13</xref>][<xref ref-type="bibr" rid="cit14">14</xref>], тогда как в других работах отмечена обратная связь [<xref ref-type="bibr" rid="cit15">15</xref>] или отсутствие такой связи [<xref ref-type="bibr" rid="cit11">11</xref>][<xref ref-type="bibr" rid="cit16">16</xref>].</p><p>Целью настоящей работы было выявление особенностей метаболомного (прежде всего, аминокислотного) профиля пациентов, инфицированных COVID-19, с различной тяжестью течения и исходами заболевания.</p></sec><sec><title>Материал и методы</title><p>Используемый материал. Для исследования аминокислотного профиля использовали замороженную сыворотку крови из коллекции биобанка Санкт-Петербургского государственного бюджетного учреждения здравоохранения (СПб ГБУЗ) "Городская больница № 40". Документы в рамках научно-исследовательского проекта "Биобанкирование и биомедицинские исследования образцов тканей и жидкостей человека" были одобрены Экспертным советом по этике СПб ГБУЗ "Городская больница № 40" на заседании № 119 от 09 февраля 2017г. У всех участников исследования было получено письменное информированное добровольное согласие на помещение их биоматериала в биобанк с последующим использованием в научных целях.</p><p>Пациенты и группы. В ретроспективное исследование были включены образцы сыворотки 935 пациентов (445 мужчин и 490 женщин) с диагнозом U07.1 — "Коронавирусная инфекция COVID-19, вирус идентифицирован" (таблица 1). Диагноз COVID-19 был поставлен на основании клинической картины и по результатам ПЦР (полимеразной цепной реакции)-тестирования.</p><table-wrap id="table-1"><caption><p>Таблица 1</p><p>Половозрастная структура обследованных групп пациентов [M±SD]</p><p>Примечание: I — группа пациентов с легким течением заболевания, II — группа пациентов со среднетяжелым течением заболевания, III — группа пациентов с тяжелым течением заболевания, IV — группа пациентов с летальным исходом заболевания, V — группа пациентов, успешно выписанных после госпитализации, VI — группа пациентов с наличием ЦШ на момент взятия биоматериала, VII — группа пациентов без ЦШ на момент взятия биоматериала. Сравнение — параметр, по которому сравниваются исследуемые группы, в скобках (n) дано общее количество пациентов из выборки, вошедших в группы. ЦШ — цитокиновый шторм, муж. — мужчины, жен. — женщины.</p></caption><table><tbody><tr><td>Сравнение</td><td>Группа</td><td>n</td><td>n (муж.)</td><td>n (жен.)</td><td>Возраст</td><td>Возраст (муж.)</td><td>Возраст (жен.)</td></tr><tr><td>Степень тяжести течения заболевания (n=935)</td><td>I</td><td>25</td><td>16</td><td>9</td><td>51±16,2</td><td>50,9±16,6</td><td>51,3±16,3</td></tr><tr><td>II</td><td>564</td><td>263</td><td>301</td><td>61,5±15,5</td><td>59,7±15,3</td><td>63,1±15,5</td></tr><tr><td>III</td><td>346</td><td>166</td><td>180</td><td>69,1±14,2</td><td>67,1±14,3</td><td>70,9±13,8</td></tr><tr><td>Исход заболевания (n=935)</td><td>IV</td><td>141</td><td>73</td><td>68</td><td>74,8±12,4</td><td>73±12,1</td><td>76,7±12,5</td></tr><tr><td>V</td><td>794</td><td>372</td><td>422</td><td>62,1±15,3</td><td>60±15,2</td><td>64±15,2</td></tr><tr><td>Наличие ЦШ (n=352)</td><td>VI</td><td>143</td><td>85</td><td>58</td><td>66,4±13,7</td><td>64,5±14,5</td><td>69,1±12</td></tr><tr><td>VII</td><td>209</td><td>86</td><td>123</td><td>61,8±15,8</td><td>58,8±16,5</td><td>63,9±15,1</td></tr></tbody></table></table-wrap><p>Для отбора пациентов в исследование использовали следующие критерии включения:</p><p>Пациенты были разделены на группы в соответствии со степенью тяжести заболевания согласно актуальной версии "Временных методических рекомендаций. Профилактика, диагностика и лечение новой коронавирусной инфекции (COVID-19)": (I) "легкое течение" — группа пациентов с легким протеканием COVID-19 без изменений при компьютерной томографии (КТ), характерных для вирусного поражения (16 мужчин и 9 женщин); (II) — "среднетяжелое течение" — группа пациентов с повышенной температурой тела (&gt;38º C), относительно низким уровнем насыщения крови кислородом и изменениями при КТ, типичными для вирусного поражения (263 мужчин и 301 женщина), (III) — "тяжелое течение" — группа пациентов с тяжелым течением COVID-19, при котором наблюдаются снижение уровня сознания, нестабильная гемодинамика и изменения при КТ вплоть до критической степени поражения и острого респираторного дистресс-синдрома (166 мужчин и 180 женщин).</p><p>Также были выделена группа IV — пациенты с летальным исходом заболевания (всего 73 мужчины и 68 женщин), а в качестве группы сравнения использовали группу пациентов, успешно выписанных после лечения — V.</p><p>Наличие ЦШ (в любой день на протяжении всей госпитализации) определялось согласно следующим условиям: уровень ферритина &gt;485 мкг/л, С-реактивного белка &gt;50 мг/л, D-димера &gt;2,5 мкг/мл, интерлейкина-6 &gt;25 пг/мл, активность лактатдегидрогеназы &gt;550 ед/л. При совпадении ≥3 условий пациента определяли в группу VI, при невыполнении всех условий пациента определяли в группу VII.</p><p>Для групп VI и VII использовали дополнительный критерий исключения: отсутствие как минимум двух параметров (лабораторных биомаркеров), использующихся для определения ЦШ, измеренных в день взятия биоматериала. После исключения общее количество пациентов в сравнении (VI и VII группы) сократилось с 935 до 352.</p><p>Метод исследования профиля метаболитов. Подготовку образцов сыворотки крови проводили в дубликатах (параллельные измерения). В качестве внутренних стандартов использовали 4-морфолинэтансульфоновую кислоту и метионин сульфат (фирмы Sigma-Aldrich). Образцы размораживали при комнатной температуре, далее к 50 мкл сыворотки крови добавляли 100 мкл раствора смеси внутренних стандартов в ацетонитриле. Полученный экстракт разбавляли водой (очищенной с использованием системы Milli-Q), центрифугировали и анализировали с использованием метода высокоэффективной жидкостной хроматографии с тандемной масс-спектрометрией (ВЭЖХ-МС/МС). Приготовленные стандартные растворы и экстракты хранили при температуре -20º С.</p><p>Контролем качества служили экстракты образцов усредненной сыворотки крови с добавкой внутренних стандартов, приготовленные по той же процедуре, что и экспериментальные образцы. Усредненную сыворотку готовили из предварительно отобранных и тщательно смешанных образцов сыворотки крови нескольких доноров, полученную смесь аликвотировали и замораживали до проведения исследования. В качестве "холостой" пробы использовали 5% раствор этилендиаминтетраацетата натрия и аликвоты растворителей в соответствующих объемах, пропущенные через все стадии пробоподготовки.</p><p>Исследование профиля метаболитов проводили с использованием жидкостного хромато-масс-спектрометра с тройным квадруполем LCMS-8050 (фирмы Shimadzu) с хроматографической системой Nexera X2. ВЭЖХ-МС/МС — анализ выполняли с применением коммерчески доступного метода "LC/MS/MS Method Package for Primary Metabolites" для анализа первичных метаболитов с использованием аналитической колонки Discovery HS F5-3 (150×2,1 мм, 3 мкм) (Supelco, Merck) в режиме мониторинга множественных реакций. Метод позволяет проводить одновременный анализ 98 первичных метаболитов (таблица 2), включающих аминокислоты, органические кислоты, нуклеотиды, нуклеозиды и коферменты. Масс-спектрометрические и хроматографические условия и параметры задавали согласно инструкции для метода "LC/MS/MS Method Package for Primary Metabolites". Сбор и обработку данных проводили с применением программного обеспечения LabSolutions по методу внутреннего стандарта.</p><table-wrap id="table-2"><caption><p>Таблица 2</p><p>Список первичных метаболитов</p></caption><table><tbody><tr><td>Гликолитическая система</td><td>Органические кислоты</td></tr><tr><td>Молочная кислота</td><td>4-аминобутановая кислота</td></tr><tr><td>Пировиноградная кислота</td><td>Аденилосукцинат</td></tr><tr><td>Цикл трикарбоновых кислот</td><td>Аргинин-янтарная кислота</td></tr><tr><td>2-кетоглутаровая кислота</td><td>Холевая кислота</td></tr><tr><td>Аконитовая кислота</td><td>Креатин</td></tr><tr><td>Лимонная кислота</td><td>Никотиновая кислота</td></tr><tr><td>Фумаровая кислота</td><td>Офтальмовая кислота</td></tr><tr><td>Изолимонная кислота</td><td>Оротовая кислота</td></tr><tr><td>Яблочная кислота</td><td>Пантотеновая кислота</td></tr><tr><td>Янтарная кислота</td><td>Таурохолевая кислота</td></tr><tr><td>Аминокислоты</td><td>Мочевая кислота</td></tr><tr><td>4-гидроксипролин</td><td>Нуклеозиды и нуклеотиды</td></tr><tr><td>Аланин</td><td>Аденин</td></tr><tr><td>Аргинин</td><td>Цитозин</td></tr><tr><td>Аспарагин</td><td>Гуанин</td></tr><tr><td>Аспарагиновая кислота</td><td>Тимин</td></tr><tr><td>Лизин</td><td>Урацил</td></tr><tr><td>Цитруллин</td><td>Ксантин</td></tr><tr><td>Цистин</td><td>Аденозин</td></tr><tr><td>Диметилглицин</td><td>Цитидин</td></tr><tr><td>Глутаминовая кислота</td><td>Гуанозин</td></tr><tr><td>Глутамин</td><td>Инозин</td></tr><tr><td>Глицин</td><td>Тимидин</td></tr><tr><td>Гистидин</td><td>Уридин</td></tr><tr><td>Гомоцистин</td><td>Аденозин 3',5'-циклический монофосфат</td></tr><tr><td>Изолейцин</td><td>Аденозинмонофосфат</td></tr><tr><td>Лейцин</td><td>Цитидин-3',5'-циклический монофосфат</td></tr><tr><td>Асимметричный диметиларгинин</td><td>Цитидинмонофосфат</td></tr><tr><td>Метионина сульфоксид</td><td>Гуанозин-3',5'-циклический монофосфат</td></tr><tr><td>Симметричный диметиларгинин</td><td>Гуанозинмонофосфат</td></tr><tr><td>Фенилаланин</td><td>Тимидин</td></tr><tr><td>Пролин</td><td>Прочие соединения</td></tr><tr><td>Серин</td><td>2-аминобутановая кислота</td></tr><tr><td>Орнитин</td><td>Ацетилкарнитин</td></tr><tr><td>Треонин</td><td>Ацетилхолин</td></tr><tr><td>Триптофан</td><td>Аллантоин</td></tr><tr><td>Тирозин</td><td>Карнитин</td></tr><tr><td>Валин</td><td>Карнозин</td></tr><tr><td>Цикл метилирования и транссульфурации</td><td>Холин</td></tr><tr><td>Цистатионин</td><td>Цитиколин</td></tr><tr><td>Цистеин</td><td>Креатинин</td></tr><tr><td>Гомоцистеин</td><td>Цистеамин</td></tr><tr><td>Метионин</td><td>ДОФА (диоксифенилаланин)</td></tr><tr><td>5-глутамилцистеин</td><td>Дофамин</td></tr><tr><td>Глутатион</td><td>Адреналин</td></tr><tr><td>Окисленный глутатион</td><td>Гистамин</td></tr><tr><td>S-аденозилгомоцистеин (SAH)</td><td>Гипоксантин</td></tr><tr><td>S-аденозилметионин (SAM)</td><td>Кинуренин</td></tr><tr><td>Коферменты</td><td>Никотинамид</td></tr><tr><td>ФАД (флавинадениндинуклеотид)</td><td>Норадреналин</td></tr><tr><td>ФМН (флавинмононуклеотид)</td><td>Серотонин</td></tr><tr><td>НАДФ (никотинамидадениндинуклеотид)</td><td>Внутренние стандарты (ISTD)</td></tr><tr><td> </td><td>2-(N-морфолино)этансульфоновая кислота</td></tr><tr><td>L-метионин сульфон</td></tr></tbody></table></table-wrap><p>Статистическая обработка данных. Для проверки гипотезы о нормальном распределении данных использовался тест Шапиро-Уилка. Для выявления межгруппового различия в уровнях концентрации исследуемых соединений использовался однофакторный дисперсионный анализ по критерию Краскела-Уоллиса, в качестве post-hoc анализа применялся критерий Манна-Уитни. В качестве меры, отображающей разность диапазона значений между выборками, использовался логарифм кратности изменения (log fold change, lfc), описательная статистика представлена медианой (Me) и интерквартильным размахом [Q25-Q75]. Для оценки связи между индексом коморбидности и концентрацией исследуемых соединений использовался коэффициент корреляции Спирмена. Различие между выборками считали значимым при p&lt;0,05 и lfc&gt;1. Обработка и статистический анализ данных выполнены с использованием языка программирования R версии 4.3.1.</p><p>Исследование выполнено в рамках проекта Санкт-Петербургского государственного университета ID 94029859 и при взаимодействии с базой Ресурсного центра Биобанк (Core facility center "Biobank").</p></sec><sec><title>Результаты</title><p>Каждый образец анализировали на наличие первичных метаболитов основных химических классов клинически значимых низкомолекулярных соединений. Для дальнейшего анализа использовали только те метаболиты, которые показали ненулевые значения как минимум в нескольких повторах. Таким образом, из 98 метаболитов, которые могут быть детектированы используемым методом, были отобраны 84 соединения.</p><p>Результаты проведенного анализа первичных метаболитов выявили различия метаболомного профиля в зависимости от тяжести заболевания для 52 из 84 детектированных соединений (со значимостью p&lt;0,01). Наибольшее различие в сравнении групп по тяжести течения COVID-19 показали следующие метаболиты: кинуренин (p&lt;0,0001; lfc=1,62), фенилаланин (p&lt;0,0001; lfc=1,13) и ацетилкарнитин (p&lt;0,0001; lfc=1,28).</p><p>Различия между группами с высоким уровнем статистической значимости обнаружены и для концентрации следующих соединений: цитруллин, орнитин, цистин, диметилглицин, асимметричный диметиларгинин (АДМА), аланин, цистатион, карнозин, 5-глутамилцистеин, аргинин (таблица 3).</p><table-wrap id="table-3"><caption><p>Таблица 3</p><p>Концентрации метаболитов в крови пациентов разных групп,разделенных по тяжести течения заболевания [Me (Q25-Q75)]</p><p>Примечание: "Значимость" — p-значение по критерию Краскела-Уоллиса. В столбцах с названием групп, перечисленных через запятую — p-значение posthoc тест (критерий Манна-Уитни) для обозначенных групп. I — группа пациентов с легким течением заболевания, II — группа пациентов со среднетяжелым течением заболевания, III — группа пациентов с тяжелым течением заболевания. В таблице представлены только те метаболиты, разница в концентрации которых была статистически значима (p≤0,01). SAH — S-аденозилгомоцистеин, SAM — S-аденозилметионин, АМФ — аденозинмонофосафт, L-ДОФА — L-диоксифенилаланин, ТМФ — тимидинмонофосфат.</p></caption><table><tbody><tr><td>Метаболит</td><td>I (легкое)</td><td>II (средне-тяжелое)</td><td>III (тяжелое)</td><td>"Значимость"</td><td>I, II</td><td>I, III</td><td>II, III</td></tr><tr><td>L-цистин</td><td>0,191 (0,132-0,667)</td><td>1,77 (0,207-5,44)</td><td>2,76 (0,395-6,07)</td><td>&lt;0,001</td><td>0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>0,001</td></tr><tr><td>L-аспарагин</td><td>1,63 (0,778-1,95)</td><td>2,6 (1,74-3,94)</td><td>2,8 (1,76-4,11)</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>0,249</td></tr><tr><td>L-аспарагиновая кислота</td><td>1,45 (0,692-1,78)</td><td>2,32 (1,51-3,31)</td><td>2,17 (1,53-3,38)</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>0,445</td></tr><tr><td>L-аланин</td><td>34,4 (25,3-38,7)</td><td>21,4 (12-32,6)</td><td>16,3 (10,4-27,5)</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>L-циста-тионин</td><td>0,042 (0,015-0,08)</td><td>0,147 (0,085-0,298)</td><td>0,201 (0,11-0,439)</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>L-яблочная кислота</td><td>0,009 (0,002-0,016)</td><td>0,016 (0,007-0,025)</td><td>0,022 (0,013-0,038)</td><td>&lt;0,001</td><td>0,029</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>L-цистеин</td><td>0,145 (0,059-0,329)</td><td>0,09 (0,02-0,255)</td><td>0,042 (0,019-0,153)</td><td>&lt;0,001</td><td>0,111</td><td>0,001</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>Цитруллин</td><td>4,12 (3,18-5,76)</td><td>2,76 (0,88-4,54)</td><td>2,02 (0,85-3,35)</td><td>&lt;0,001</td><td>0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>L-пролин</td><td>10,1 (8,41-16,9)</td><td>26,9 (11,9-44,9)</td><td>31,8 (14,6-51,8)</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>0,033</td></tr><tr><td>Орнитин</td><td>7,87 (6,29-10,6)</td><td>5,89 (3,12-9,3)</td><td>4,47 (2,79-6,85)</td><td>&lt;0,001</td><td>0,005</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>ТМФ</td><td>0,001 (0-0,002)</td><td>0,004 (0-0,074)</td><td>0,029 (0,001-0,358)</td><td>&lt;0,001</td><td>0,002</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>Серин</td><td>9,43 (2,76-11,6)</td><td>15 (9,7-21,4)</td><td>15 (9,04-19,9)</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>0,392</td></tr><tr><td>Фумаровая кислота</td><td>0 (0-0)</td><td>0 (0-0)</td><td>0 (0-0,007)</td><td>&lt;0,001</td><td>0,005</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>5-глутамил-цистеин</td><td>0 (0-0)</td><td>0 (0-0,014)</td><td>0,009 (0-0,018)</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>Креатинин</td><td>26,9 (23,9-32,3)</td><td>38,7 (29,5-53,1)</td><td>44,8 (30,8-60,5)</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>0,001</td></tr><tr><td>Норадреналин</td><td>2,99 (1,58-3,39)</td><td>1,54 (0,106-2,48)</td><td>1,19 (0,086-2,33)</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>0,022</td></tr><tr><td>Карнозин</td><td>0,07 (0,03-0,11)</td><td>0,026 (0,006-0,07)</td><td>0,017 (0,004-0,055)</td><td>&lt;0,001</td><td>0,003</td><td>&lt;0,001</td><td>0,001</td></tr><tr><td>SAM</td><td>1,3e-10 (0-0,004)</td><td>0 (0-0,003)</td><td>0 (0-0)</td><td>&lt;0,001</td><td>0,022</td><td>&lt;0,001</td><td>0,001</td></tr><tr><td>Асимметричный диметиларгинин</td><td>0,504 (0,419-0,659)</td><td>0,233 (0,007-0,52)</td><td>0,041 (0,004-0,4)</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>0,001</td></tr><tr><td>Симметричный диметиларгинин</td><td>0,132 (1,28e-10-0,588)</td><td>0,039 (0,008-0,134)</td><td>0,018 (0-0,098)</td><td>&lt;0,001</td><td>0,085</td><td>0,004</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>SAH</td><td>0,014 (0,004-0,021)</td><td>0,014 (0-0,028)</td><td>0,022 (0,009-0,037)</td><td>&lt;0,001</td><td>0,568</td><td>0,008</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>L-кинуренин</td><td>1,21 (0,813-1,98)</td><td>1,6 (1,13-2,19)</td><td>1,96 (1,29-2,86)</td><td>&lt;0,001</td><td>0,012</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>L-фенил-аланин</td><td>107 (59,2-148)</td><td>144 (82,8-219)</td><td>173 (106-243)</td><td>&lt;0,001</td><td>0,021</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>L- ацетил-карнитин</td><td>45,5 (36,4-57,9)</td><td>68,2 (43-103)</td><td>86 (52,6-135)</td><td>&lt;0,001</td><td>0,002</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>Гистамин</td><td>0 (0-0,011)</td><td>0,0154 (0-0,029)</td><td>0,022 (0,006-0,048)</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>Аллантоин</td><td>0,01 (0,006-0,0147)</td><td>0,015 (0,007-0,023)</td><td>0,017 (0,01-0,032)</td><td>0,001</td><td>0,047</td><td>0,002</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>Диметилглицин</td><td>1,32 (0,898-1,83)</td><td>1,83 (1,25-2,66)</td><td>2,1 (1,3-3,64)</td><td>0,001</td><td>0,005</td><td>&lt;0,001</td><td>0,002</td></tr><tr><td>Глицин</td><td>2,4 (0,838-4,04)</td><td>3,78 (2,5-5,65)</td><td>3,3 (2,19-4,86)</td><td>0,001</td><td>0,005</td><td>0,046</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>L-карнитин</td><td>20,4 (17,5-24,2)</td><td>26,4 (20,8-33,4)</td><td>27,5 (21,2-34,8)</td><td>0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>0,182</td></tr><tr><td>Цитиколин</td><td>0,002 (0-0,005)</td><td>0,01 (0,002-0,023)</td><td>0,009 (0,002-0,022)</td><td>0,0012</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>0,404</td></tr><tr><td>L-треонин</td><td>7,48 (5,87-10,4)</td><td>8,05 (5,92-11,2)</td><td>7,07 (4,81-10,1)</td><td>0,0012</td><td>0,249</td><td>0,803</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>Пировиноградная кислота</td><td>0 (0-0,043)</td><td>0,027 (0-0,052)</td><td>0,021 (0-0,036)</td><td>0,001</td><td>0,035</td><td>0,211</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>Лимонная кислота</td><td>0 (0-0,064)</td><td>0,067 (0,02-0,153)</td><td>0,069 (0,016-0,191)</td><td>0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>0,46</td></tr><tr><td>Аденозин</td><td>0,132 (0,063-0,186)</td><td>0,166 (0,065-0,435)</td><td>0,245 (0,087-0,46)</td><td>0,001</td><td>0,112</td><td>0,005</td><td>0,001</td></tr><tr><td>Серотонин</td><td>0,046 (0,029-0,096)</td><td>0,08 (0,032-0,19)</td><td>0,047 (0,026-0,141)</td><td>0,001</td><td>0,057</td><td>0,652</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>L-глутамин</td><td>42,8 (34,8-87,3)</td><td>109 (53,5-160)</td><td>111 (57,4-162)</td><td>0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>0,429</td></tr><tr><td>АМФ</td><td>2,07e-09 (1e-09-0,001)</td><td>0,006 (1,95e-09-0,019)</td><td>0,012 (0,001-0,022)</td><td>0,001</td><td>0,018</td><td>0,002</td><td>0,009</td></tr><tr><td>Цитидин</td><td>0,001 (0-0,003)</td><td>0 (0-4,21e-4)</td><td>0 (0-0,002)</td><td>0,001</td><td>&lt;0,001</td><td>0,001</td><td>0,492</td></tr><tr><td>Тимидин</td><td>0 (0-0)</td><td>0 (0-0)</td><td>0 (0-0)</td><td>0,001</td><td>0,423</td><td>0,609</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>Цистеамин</td><td>0 (0-0)</td><td>0 (0-1,02e-11)</td><td>0 (0-0,001)</td><td>0,001</td><td>0,005</td><td>0,001</td><td>0,03</td></tr><tr><td>Никотинамид</td><td>0,112 (0,037-0,261)</td><td>0,132 (0,055-0,233)</td><td>0,169 (0,076-0,298)</td><td>0,002</td><td>0,595</td><td>0,11</td><td>0,001</td></tr><tr><td>DL-гомоцистин</td><td>0,004 (0-0,016)</td><td>0,003 (0-0,0144)</td><td>0,002 (0-0,007)</td><td>0,002</td><td>0,506</td><td>0,709</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>Урацил</td><td>0,06 (0,037-0,067)</td><td>0,0382 (0,017-0,071)</td><td>0,0326 (0,012-0,06)</td><td>0,002</td><td>0,052</td><td>0,003</td><td>0,01</td></tr><tr><td>Офтальмовая кислота</td><td>0 (0-0)</td><td>0 (0-0,002)</td><td>0 (0-0,002)</td><td>0,003</td><td>0,003</td><td>0,001</td><td>0,159</td></tr><tr><td>Метаболит</td><td>I (легкое)</td><td>II (средне-тяжелое)</td><td>III (тяжелое)</td><td>"Значимость"</td><td>I, II</td><td>I, III</td><td>II, III</td></tr><tr><td>Дофамин</td><td>0,01 (0,004-0,0184)</td><td>0,0084 (1,75e-08-0,0158)</td><td>0,011 (0,004-0,018)</td><td>0,004</td><td>0,522</td><td>0,639</td><td>0,001</td></tr><tr><td>Изолимонная кислота</td><td>0 (0-0,04)</td><td>0,0142 (0,003-0,032)</td><td>0,01 (0-0,028)</td><td>0,004</td><td>0,017</td><td>0,085</td><td>0,011</td></tr><tr><td>L-ДОФА</td><td>0,01 (0-0,016)</td><td>0,008 (0-0,016)</td><td>0,011 (0,002-0,018)</td><td>0,004</td><td>0,997</td><td>0,286</td><td>0,001</td></tr><tr><td>L-тирозин</td><td>36,9 (20,9-47,4)</td><td>46,6 (27,8-82)</td><td>53,6 (31-81,5)</td><td>0,006</td><td>0,021</td><td>0,002</td><td>0,072</td></tr><tr><td>L-лизин</td><td>75,4 (56-125)</td><td>141 (64,3-219)</td><td>153 (69,7-226)</td><td>0,006</td><td>0,006</td><td>0,002</td><td>0,213</td></tr><tr><td>L-гистидин</td><td>29,1 (23,1-34,1)</td><td>20,8 (12,7-33,2)</td><td>19,6 (11,6-31,9)</td><td>0,006</td><td>0,008</td><td>0,003</td><td>0,136</td></tr><tr><td>Холевая кислота</td><td>0,002 (0,001-0,003)</td><td>0,002 (7,23e-4-0,004)</td><td>0,001 (4,33e-4-0,003)</td><td>0,008</td><td>0,967</td><td>0,299</td><td>0,002</td></tr><tr><td>L-валин</td><td>73,8 (60,1-82)</td><td>87,7 (66,9-118)</td><td>89,9 (68,1-116)</td><td>0,01</td><td>0,004</td><td>0,002</td><td>0,653</td></tr><tr><td>2-кето-глутаровая кислота</td><td>0,194 (5,71e-08-0,6)</td><td>0,303 0,131-0,592)</td><td>0,42 (0,137-0,836)</td><td>0,01</td><td>0,386</td><td>0,169</td><td>0,004</td></tr></tbody></table></table-wrap><p>Кроме того, при прогрессировании тяжести COVID-19 последовательно изменялись уровни содержания тирозина, гистидина, пролина, треонина, симметричного диметиларгинина (СДМА), креатинина, аденозина, тимидинмонофосфата (ТМФ), цитозина, S-аденозилгомоцистеина (SAH), никотинамида.</p><p>Отличия в метаболическом профиле пациентов I группы с COVID-19 от II группы наблюдались для более чем 30 исследованных соединений (таблица 3). Для II группы пациентов были выявлены повышенные уровни кинуренина, фенилаланина, ацетилкарнитина, диметилглицина, пролина, цитозина, тирозина, аденозина, SAH, ТМФ, а несколько меньше для изолейцина, аллантоина, аспарагина, аспарагиновой кислоты, 4-гидроксипролина, цистатиона, лизина, глицина, 5-глутамилцистеина, глутатиона, валина, серина, аденозинмонофосфата (АМФ), 2-кетоглутаровой, яблочной и оротовой кислот, креатина, лимонной, 2-аминобутановой и никотиновой кислот, гипоксантина, гомоцистина, холина, уридина, креатинина, карнитина, никотинамида, офтальмовой кислоты, карнозина, гуанозина, аденина, адреналина, гистамина.</p><p>В то же время уровни треонина, орнитина, цитруллина, цистеина, АДМА и СДМА, гистидина, аргинина, аланина, изолимонной и пировиноградной кислот, АМФ, глицина, норадреналина, S-аденозилметионина (SAM), холевой кислоты у пациентов II группы были ниже, чем у пациентов I группы.</p><p>Метаболический профиль пациентов III группы характеризовался дальнейшим изменением уровней тех же соединений, которые отличали I группу от II. Дополнительно были отмечены различия в уровнях изолимонной кислоты, АМФ и урацила.</p><p>При этом метаболомные профили I и III групп различались уровнями 4-гидроксипролина, аллантоина, СДМА, уридина, аденозина и SAH.</p><p>Уровни ацетилхолина, лейцина, глутамина и глутаминовой кислоты, метионин сульфоксида, гидроксилизина, гомоцистина, 2-аминобутановой кислоты, глутатиона, карнозина, триптофана, инозина, холина, пантотеновой кислоты, цитидина, аденина, адреналина, дофамина, серотонина в метаболомных профилях пациентов различных групп различались незначительно.</p><p>Для пациентов с ЦШ наблюдались повышенные уровни кинуренина, треонина, фенилаланина, глицина, 4-гидроксипролина, цитруллина, SAH, цитозина, цистатиона, ацетилкарнитина по сравнению с пациентами без ЦШ (таблица 4).</p><table-wrap id="table-4"><caption><p>Таблица 4</p><p>Концентрации метаболитов в крови пациентов разных групп,разделенных по наличию ЦШ [Me (Q25-Q75)]</p><p>Примечание: VI — группа пациентов с наличием ЦШ на момент взятия биоматериала, VII — группа пациентов без ЦШ на момент взятия биоматериала. "Значимость" — p-значение по критерию Манна-Уитни. В таблице представлены только те метаболиты, разница в концентрации которых была статистически значима (p≤0,01). ЦШ — цитокиновый шторм, SAH — S-aденозилгомоцистеин.</p></caption><table><tbody><tr><td>Метаболит</td><td>VII (пациенты без ЦШ)</td><td>VI (пациенты с ЦШ)</td><td>p-значение</td></tr><tr><td>L-треонин</td><td>8,46 (6,27-11,5)</td><td>6,72 (4,67-9,26)</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>L-кинуренин</td><td>1,5 (1,03-2,06)</td><td>2,12 (1,47-2,94)</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>Глицин</td><td>4 (2,54-5,87)</td><td>3 (2,06-4,65)</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>L-фенилаланин</td><td>141 (79,4-204)</td><td>180 (113-270)</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>L-ацетилкарнитин</td><td>71,4 (38,9-101)</td><td>88,1 (54,7-135)</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>SAH</td><td>0,014 (0-0,026)</td><td>0,021 (0,009-0,04)</td><td>0,001</td></tr><tr><td>4-гидроксипролин</td><td>2,56 (1,62-3,54)</td><td>1,83 (1,24-3,13)</td><td>0,001</td></tr><tr><td>Цитруллин</td><td>2,82 (0,859-4,21)</td><td>1,77 (0,795-2,9)</td><td>0,001</td></tr><tr><td>Цитозин</td><td>0,01 (0,001-0,023)</td><td>0,018 (0,005-0,033)</td><td>0,002</td></tr><tr><td>L-цистатионин</td><td>0,138 (0,083-0,265)</td><td>0,181 (0,112-0,423)</td><td>0,004</td></tr></tbody></table></table-wrap><p>Различие в метаболомных профилях между выжившими и умершими пациентами отмечалось для 37 соединений из 82 (таблица 5). Различия с высоким уровнем значимости были зафиксированы для цистина (p&lt;0,0005; lfc=1,36), цистеина (p&lt;0,0001; lfc=1,81) и диметилглицина (p&lt;0,0001; lfc=1,29). В метаболоме умерших пациентов наблюдались существенно более низкие уровни треонина, цистеина, гомоцистина, гидроксилизина, гипоксантина, изолимонной, пировиноградной и холевой кислот, серотонина. В то же время уровни кинуренина, фенилаланина, цитруллина, цитозина, диметилглицина, гистамина, 5-глутамилцистеина, цистина, карнитина, креатинина, креатина, цистатиона, лейцина и изолейцина, АМФ, ТМФ, SAH, ацетилкарнитина, 2-кетоглутаровой, яблочной, пантотеновой, молочной, мочевой и фумаровой кислот, никотинамида, дофамина были выше, чем у выживших пациентов.</p><table-wrap id="table-5"><caption><p>Таблица 5</p><p>Концентрации метаболитов в крови пациентов разных групп,разделенных по исходу заболевания [Me (Q25-Q75)]</p><p>Примечание: IV — группа пациентов с летальным исходом заболевания, V — группа пациентов, успешно выписанных после госпитализации. "Значимость" — p-значение по критерию Манна-Уитни. В таблице представлены только те метаболиты, разница в концентрации которых была статистически значима (p≤0,01). АМФ — аденозинмонофосфат, L-ДОФА — L-диоксифенилаланин, SAH — S-aденозилгомоцистеин.</p></caption><table><tbody><tr><td>Метаболит</td><td>V (выжившие)</td><td>IV (умершие)</td><td>p</td></tr><tr><td>L-треонин</td><td>7,88 (5,71-11,1)</td><td>6,9 (4,32-8,93)</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>L-цистатионин</td><td>0,15 (0,085-0,303)</td><td>0,251 (0,126-0,769)</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>L-яблочная кислота</td><td>0,017 (0,008-0,026)</td><td>0,023 (0,013-0,045)</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>Изолимонная кислота</td><td>0,014 (0,002-0,032)</td><td>0,005 (0-0,022)</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>Пировиноградная кислота</td><td>0,026 (0-0,049)</td><td>0,016 (0-0,031)</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>L-молочная кислота</td><td>12,3 (8,71-17,1)</td><td>15,6 (11,3-22,9)</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>Мочевая кислота</td><td>3,91 (2,7-5,66)</td><td>5,17 (3,46-7,85)</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>Креатин</td><td>13 (7,94-21,9)</td><td>17,1 (9,61-40,3)</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>Креатинин</td><td>38,9 (29,2-53,1)</td><td>49,3 (32,7-70,5)</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>Пантотеновая кислота</td><td>0,089 (0,063-0,118)</td><td>0,106 (0,077-0,156)</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>Дофамин</td><td>0,009 (0,001-0,016)</td><td>0,0135 (0,006-0,019)</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>SAH</td><td>0,015 (0-0,028)</td><td>0,032 (0,018-0,055)</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>L-кинуренин</td><td>1,63 (1,14-2,26)</td><td>2,4 (1,5-3,5)</td><td>&lt;0,0001</td></tr><tr><td>L-фенилаланин</td><td>145 (83,9-218)</td><td>202 (143-258)</td><td>&lt;0,0001</td></tr><tr><td>L-ацетилкарнитин</td><td>68,1 (43-104)</td><td>110 (68,1-175)</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>L-ДОФА</td><td>0,008 (0-0,016)</td><td>0,013 (0,006-0,019)</td><td>&lt;0,001</td></tr><tr><td>2-кетоглутаровая кислота</td><td>0,307 (0,129-0,598)</td><td>0,581 (0,149-1,09)</td><td>0,001</td></tr><tr><td>Тимидинмонофосфат</td><td>0,006 (0-0,104)</td><td>0,025 (0,002-0,348)</td><td>0,001</td></tr><tr><td>DL-гомоцистин</td><td>0,003 (0-0,014)</td><td>0,001 (0-0,004)</td><td>0,001</td></tr><tr><td>Цитруллин</td><td>2,63 (0,89-4,29)</td><td>1,97 (0,78-3,04)</td><td>0,001</td></tr><tr><td>Гидроксилизин</td><td>0 (0-0,136)</td><td>0 (0-0,009)</td><td>0,001</td></tr><tr><td>Гистамин</td><td>0,0162 (0-0,031)</td><td>0,025 (0-0,056)</td><td>0,001</td></tr><tr><td>L-цистин</td><td>1,88 (0,208-5,49)</td><td>2,83 (1,37-6,11)</td><td>0,001</td></tr><tr><td>АМФ</td><td>0,006 (1,58e-09-0,012)</td><td>0,014 (0,001-0,024)</td><td>0,001</td></tr><tr><td>Фумаровая кислота</td><td>0 (0-2,11e-08)</td><td>0 (0-0,009)</td><td>0,001</td></tr><tr><td>L-цистеин</td><td>0,075 (0,021-0,241)</td><td>0,034 (0,019-0,123)</td><td>0,001</td></tr><tr><td>Цитозин</td><td>0,013 (0,003-0,028)</td><td>0,021 (0,004-0,046)</td><td>0,001</td></tr><tr><td>Гипоксантин</td><td>0,786 (0,387-1,29)</td><td>1,07 (0,504-1,72)</td><td>0,001</td></tr><tr><td>L-карнитин</td><td>26 (20,4-32,9)</td><td>28,6 (23,1-39,7)</td><td>0,001</td></tr><tr><td>Холевая кислота</td><td>0,002 (6,61e-4-0,004)</td><td>9,92e-4(0,0002-0,003)</td><td>0,001</td></tr><tr><td>Тимидин</td><td>0 (0-0)</td><td>0 (0-0)</td><td>0,001</td></tr><tr><td>L-изолейцин</td><td>43 (27,2-74,4)</td><td>56,4 (34,6-82,6)</td><td>0,003</td></tr><tr><td>Серотонин</td><td>0,07 (0,03-0,181)</td><td>0,039 (0,025-0,123)</td><td>0,003</td></tr><tr><td>5-глутамилцистеин</td><td>0 (0-0,015)</td><td>0,01 (0-0,017)</td><td>0,003</td></tr><tr><td>Никотинамид</td><td>0,136 (0,058-0,251)</td><td>0,184 (0,089-0,286)</td><td>0,003</td></tr><tr><td>L-лейцин</td><td>67,3 (41,7-110)</td><td>87,7 (55,5-123)</td><td>0,009</td></tr><tr><td>Диметилглицин</td><td>1,83 (1,25-2,72)</td><td>2,28 (1,34-4,1)</td><td>0,0099</td></tr></tbody></table></table-wrap><p>При этом по уровню аллантоина, гистидина, пролина, аспарагина и аспарагиновой кислоты, орнитина, аргинина, карнитина, валина, серина, триптофана, метионина, глицина, цитидина, инозина, аденина, оротовой и 4-аминобутановой кислот, холина, уридина, никотиновой и офтальмовой кислот, адреналина, урацила эти группы пациентов практически не различались между собой.</p><p>Индекс коморбидности Чарлсона у пациентов с COVID-19 был значимо связан только с 4-мя метаболитами: серином (p&lt;0,0001; ρ=0,28), цитидином (p&lt;0,0001; ρ=0,28), цитидинмонофосфатом (p&lt;0,0001; ρ=0,26) и SAH (p&lt;0,0001; ρ=0,31).</p></sec><sec><title>Обсуждение</title><p>Согласно полученным результатам, наиболее ассоциированными с тяжестью протекания COVID-19 являются кинуренин, фенилаланин и ацетилкарнитин. Это согласуется с данными о повышении уровней кинуренина и фенилаланина для пациентов с COVID-19 [<xref ref-type="bibr" rid="cit3">3</xref>][<xref ref-type="bibr" rid="cit10">10</xref>][<xref ref-type="bibr" rid="cit17">17</xref>][<xref ref-type="bibr" rid="cit18">18</xref>] и их отрицательной корреляции с тяжестью инфекции [<xref ref-type="bibr" rid="cit6">6</xref>][<xref ref-type="bibr" rid="cit12">12</xref>]. Увеличение уровня кинуренина при COVID-19 связывают с усилением деградации триптофана из-за сверхактивации иммунного ответа через повышение уровня интерферона-гамма (усиление воспалительного ответа) и сильную активацию Т-клеток [<xref ref-type="bibr" rid="cit1">1</xref>][<xref ref-type="bibr" rid="cit17">17</xref>]; отмечена взаимосвязь метаболитов кинуренинового пути с промежуточными продуктами цикла трикарбоновых кислот, воспалительной реакцией и гибелью клеток [<xref ref-type="bibr" rid="cit4">4</xref>]. В ряде работ наблюдали взаимосвязь уровней фенилаланина и треонина плазмы с маркерами воспаления интерлейкин-6/фактор некроза опухоли, что указывает на существенную роль биосинтеза фенилаланина в иммунном ответе организма на вирус COVID-19 [<xref ref-type="bibr" rid="cit6">6</xref>][<xref ref-type="bibr" rid="cit13">13</xref>]. Однако в нашем исследовании изменение уровней триптофана и треонина у пациентов с COVID-19 разных групп было незначительным.</p><p>Ацетилкарнитины играют существенную роль в энергетическом обмене и переносе жирных кислот в митохондрии. Дисбаланс ацетилкарнитинов при COVID-19 отмечен в ряде работ [<xref ref-type="bibr" rid="cit3">3</xref>][<xref ref-type="bibr" rid="cit13">13</xref>][<xref ref-type="bibr" rid="cit17">17</xref>]. Респираторные вирусы типа вируса гриппа усугубляют накопление ацетилкарнитина; увеличение содержания ацетилкарнитинов в плазме пациентов с COVID-19 может быть обусловлено тем же механизмом [<xref ref-type="bibr" rid="cit13">13</xref>].</p><p>Четкая корреляция с тяжестью COVID-19 зафиксирована также для цитруллина, орнитина, цистина, диметилглицина, АДМА, аланина, цистатиона, карнозина, 5-глутамилцистеина, аргинина.</p><p>Кроме того, при прогрессировании тяжести COVID-19 последовательно изменялись уровни содержания тирозина, аденозина, гистидина, креатинина, ТМФ, пролина, треонина, цитозина, СДМА, SAH, никотинамида, что согласуется с данными о корреляции путей биосинтеза тирозина с тяжестью протекания COVID-19 [<xref ref-type="bibr" rid="cit19">19</xref>], а также о взаимосвязи между тяжелым течением COVID-19 и уровнями таких аминокислот, как фенилаланин, пролин, валин, глутамат, глутамин, триптофан, гистидин, аланин, лейцин, изолейцин, цистеин [<xref ref-type="bibr" rid="cit20">20</xref>][<xref ref-type="bibr" rid="cit21">21</xref>].</p><p>Нарушение синтеза и метаболизма аминокислот аргинина, треонина, орнитина, цитруллина и аланина у пациентов с COVID-19, особенно в условиях гипоксии, отмечено во многих работах [<xref ref-type="bibr" rid="cit11">11</xref>][<xref ref-type="bibr" rid="cit13">13</xref>][<xref ref-type="bibr" rid="cit18">18</xref>][<xref ref-type="bibr" rid="cit20">20</xref>][<xref ref-type="bibr" rid="cit21">21</xref>]. Снижение в сыворотке пациентов с COVID-19 уровней глутамата, цитруллина, орнитина, глутамина, мочевины и фумарата, а также АДМА и СДМА связывали с нарушениями функции печени [<xref ref-type="bibr" rid="cit16">16</xref>].</p><p>Метаболический профиль пациентов с COVID-19 в тяжелом состоянии (III группа) характеризовался значительно бóльшими изменениями по сравнению с I и II группами (таблица 3) и затрагивал все исследованные классы метаболитов, что свидетельствует о системных метаболических нарушениях, возникающих в результате развития COVID-19 и влияющих на функционирование различных органов и систем организма.</p><p>В метаболомном профиле пациентов с ЦШ отмечены повышенные уровни кинуренина, треонина, фенилаланина, глицина, 4-гидроксипролина, цитруллина, SAH, цитозина, цистатиона, ацетилкарнитина по сравнению с пациентами без ЦШ, что еще раз подчеркивает взаимосвязь этих соединений (особенно, кинуренина, фенилаланина и треонина) с тяжестью COVID-19 (таблица 4).</p><p>Аминокислота цитруллин вырабатывается практически исключительно энтероцитами и используется в качестве биомаркера массы и функции энтероцитов тонкой кишки. COVID-19 может инфицировать клетки кишечника человека, а также реплицироваться в линиях эпителиальных клеток кишечника и органоидных моделях толстой кишки человека, участвуя, таким образом, в распространении COVID-19 с повышенной виремией [<xref ref-type="bibr" rid="cit22">22</xref>]. Исследование различий в уровнях аминокислот в плазме между острой стадией и стадиями выздоровления у людей с внебольничной пневмонией показало, что уровни аргинина и цитруллина в плазме снижаются [<xref ref-type="bibr" rid="cit21">21</xref>], что согласуется с полученными нами данными.</p><p>Повышенные уровни цитозина в плазме у пациентов с COVID-19 могут быть связаны с ускользанием вируса от врожденного иммунитета [<xref ref-type="bibr" rid="cit23">23</xref>], а метаболиты на основе цитозина являются координаторами клеточного метаболизма при COVID-19, и имеют большое значение для врожденного противовирусного иммунитета и эволюции вируса.</p><p>Метаболомные профили выживших и умерших пациентов различались прежде всего уровнями кинуренина, фенилаланина, треонина, цитруллина, креатина и креатинина, цистатиона, цистина, карнитина, гидроксилизина, цистеина, диметилглицина, АМФ, ТМФ, цитозина, лейцина, изолейцина, гистамина, гомоцистина, 5-глутамилцистеина, 2-кетоглутаровой, яблочной, и изолимонной, пировиноградной, молочной, мочевой, фумаровой и пантотеновой кислот, SAH, ацетилкарнитина, холевой кислоты, серотонина, дофамина, никотинамида, гипоксантина (таблица 5). Наблюдаемое значительное увеличение содержание креатина и креатинина в метаболомных профилях умерших пациентов по сравнению с выжившими свидетельствует о развитии почечной дисфункции [<xref ref-type="bibr" rid="cit17">17</xref>].</p><p>Максимальные различия в метаболических профилях между выжившими и умершими пациентами зафиксированы для цистина, цистеина и диметилглицина. Снижение уровня диметилглицина у пациентов с неблагоприятным течением COVID-19 отмечено также Silvagno F, et al. [<xref ref-type="bibr" rid="cit24">24</xref>].</p><p>Падение уровней глутатиона наблюдали [<xref ref-type="bibr" rid="cit24">24</xref>][<xref ref-type="bibr" rid="cit25">25</xref>] при заболеваниях, повышающих риск COVID-19, а возникающий дефицит глутатиона связывали с тяжестью протекания и смертью у пациентов с COVID-19. В нашем исследовании корреляции уровней глутатиона с развитием ЦШ или летальными исходами не наблюдалось, но установлена корреляция с цистином и цистеином — продуктами катаболизма глутатиона. Увеличение уровней цистина и цистеина в плазме пациентов с COVID-19 при усилении тяжести инфекции (от средней к тяжелой форме протекания инфекции) было зафиксировано также в работе [<xref ref-type="bibr" rid="cit26">26</xref>]. L-цистин образуется во внеклеточном пространстве из восстановленного глутатиона, функционирует как общий маркер инфекции и может служить индикатором выработки глутатиона и активности его цикла в условиях окислительного стресса [<xref ref-type="bibr" rid="cit24">24</xref>][<xref ref-type="bibr" rid="cit26">26</xref>].</p><p>О дисбалансе цистина и цистеина в зависимости от тяжести заболевания COVID-19, иммунной активности и наличия сопутствующих заболеваний также сообщалось Páez-Franco JC [<xref ref-type="bibr" rid="cit27">27</xref>]. Отмечается, что уровни цистина имеют решающее значение для борьбы с активными формами кислорода при COVID-19, а также при некоторых злокачественных новообразованиях. Корреляция уровня цистина с уровнями аланинаминотрансферазы и аспартатаминотрансферазы у пациентов с тяжелой формой COVID-19 может указывать на потенциальное участие печени в метаболизме цистеина и цистина при COVID-19, что может быть вероятным, поскольку этот орган является основным местом синтеза глутатиона и часто поражается при тяжелой форме COVID-19 [<xref ref-type="bibr" rid="cit27">27</xref>].</p><p>Цистеин/цистин, цистеинилглицин/цистинилглицин и глутатион/глутатиондисульфид являются основными окислительно-восстановительными парами тиол/дисульфидного равновесия во внеклеточной жидкости, являясь биологическим индикатором возрастного снижения системного окислительно-восстановительного потенциала и его метаболического и функционального влияния на ткани, включая легкие [<xref ref-type="bibr" rid="cit28">28</xref>]. COVID-19 нарушает цистин-цистеиновый цикл клетки и механизмы окислительно-восстановительного гомеостаза внеклеточных тиолов и способствует созданию прооксидантной среды в инфицированной ткани для процесса репликации вируса. Действительно, предпочтительное включение клеточного цистеина в вирусные белки, а не в глутатион клеточных белков наблюдается как общий механизм и при других типах вирусных инфекций [<xref ref-type="bibr" rid="cit28">28</xref>].</p><p>Повышение уровня SAM в метаболомных профилях пациентов с высоким значением индекса комордбидности можно рассматривать как маркер риска поражения легких у больных COVID-19 и, возможно, как фактор, связанный с развитием воспалительного процесса, т.к. SAM и SAH являются индикаторами глобального трансметилирования и могут играть важную роль в качестве маркеров тяжести COVID-19 [<xref ref-type="bibr" rid="cit29">29</xref>].</p><p>В литературе отмечается возможная специфичная для пола связь с тяжестью протекания и клиническими исходами при COVID-19 [<xref ref-type="bibr" rid="cit30">30</xref>]. Отмечается, что мужчины имеют более высокий риск тяжелой формы заболевания COVID-19. Считается, что основным фактором, ответственным за это, является кинуреновая кислота (КК) — эндогенный лиганд арильного углеводородного рецептора (AhR). КК положительно связана с иммунными маркерами, особенно у мужчин, и отрицательно связана с количеством Т-клеток. При этом у женщин с COVID-19 наблюдали более сильную активацию Т-клеток, чем у мужчин. Стоит отметить, что активированный AhR является главным регулятором иммунных реакций и воспаления. Изменения в пути AhR опосредуют дифференциальный иммунный ответ у мужчин, особенно потому, что этот путь ингибируется тестостероном, уровень которого снижается у пожилых лиц мужского пола. Это согласуется с повышенной уязвимостью здоровых пожилых мужчин к активации AhR эндогенными соединениями. Сахарный диабет 2 типа и ожирение повышают активность лиганда AhR, а также увеличивают риск заражения COVID-19. При наличии обоих этих факторов возрастает риск цитокинового шторма в результате COVID-19 у пожилых мужчин. Таким образом, различия в иммунном ответе между полами связывают с метаболизмом кинуренина и КК. В нашем исследовании на основании моделей логистической регрессии среди соединений, на концентрацию которых оказывал влияние пол пациента, были выделены креатин (p&lt;0,001), креатинин (p&lt;0,001), кинуренин (p&lt;0,001), аланин (p=0,025), глицин (p=0,049) и серин (p=0,045).</p></sec><sec><title>Заключение</title><p>Согласно полученным результатам, наиболее ассоциированными с тяжестью протекания COVID-19 являются кинуренин, фенилаланин, цитруллин, треонин, креатин и креатинин. Максимальное различие в метаболомных профилях между выжившими и умершими пациентами отмечалось для цистина, цистеина и диметилглицина. Влияние коморбидности сказывалось на уровнях серина, цитидина, цитидинмонофосфата и SAH, а пол пациентов оказывал влияние на уровни аланина, глицина и серина.</p><p>Резюмируя полученные результаты, следует отметить, что COVID-19 оказывает наибольшее влияние на метаболические пути, связанные с метаболизмом аминокислот и соединений, входящих в цикл трикарбоновых кислот (лимонная, изолимонная и оротовая кислоты). Возникающее вследствие этого нарушение клеточного метаболизма аминокислот приводит к нарушению множества физиологических процессов и может быть одним из критических механизмов, лежащих в основе патогенеза COVID-19.</p><p>Насколько известно, это первое метаболомное исследование, проведенное с использованием биобанка со значительной выборкой пациентов из Санкт-Петербурга и Ленинградской области (РФ). Настоящее исследование стало возможным благодаря наличию биобанка в структуре СПб ГБУЗ "Городская больница № 40", что позволило своевременно получить и сохранить нужные образцы и объемы крови пациентов, а в затем сформировать оптимальные для исследования когорты пациентов.</p><p>Отношения и деятельность: все авторы заявляют об отсутствии потенциального конфликта интересов, требующего раскрытия в данной статье.</p></sec></body><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Chen X, Gu M, Li T, et al. Metabolite reanalysis revealed potential biomarkers for COVID­19: a potential link with immune response. Future Microbiol. 2021;16:577­88. doi:10.2217/fmb­2021­0047.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Chen X, Gu M, Li T, et al. Metabolite reanalysis revealed potential biomarkers for COVID-19: a potential link with immune response. Future Microbiol. 2021;16:577-588. doi: 10.2217/fmb-2021-0047.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Mierzchala­ Pasierb M, Lipinska­ Gediga M, Fleszar MG, et al. Altered profiles of serum amino acids in patients with sepsis and septic shock — Preliminary findings. Arch Biochem Biophys. 2020;30;691:108508. doi:10.1016/j.abb.2020.108508.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Mierzchala-Pasierb M, Lipinska-Gediga M, Fleszar MG, et al. Altered profiles of serum amino acids in patients with sepsis and septic shock - Preliminary findings. Arch Biochem Biophys. 2020;30;691:108508. doi: 10.1016/j.abb.2020.108508.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Costanzo M, Caterino M, Fedele R, et al. COVIDomics: The Proteomic and Metabolomic Signatures of COVID­19. Int J Mol Sci. 2022;22;23(5):2414. doi:10.3390/ijms23052414.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Costanzo M, Caterino M, Fedele R, et al. COVIDomics: The Proteomic and Metabolomic Signatures of COVID-19. Int J Mol Sci. 2022; 22;23(5):2414. doi: 10.3390/ijms23052414.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Beloborodova NV, Olenin AY, Pautova AK. Metabolomic findings in sepsis as a damage of host­microbial metabolism integration. J Crit Care. 2018;43:246­55. doi:10.1016/j.jcrc.2017.09.014.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Beloborodova NV, Olenin AY, Pautova AK. Metabolomic findings in sepsis as a damage of host-microbial metabolism integration. J Crit Care. 2018;43:246-255. doi: 10.1016/j.jcrc.2017.09.014.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Wan S, Xiang Y, Fang W, et al. Clinical features and treatment of COVID­19 patients in northeast Chongqing. J Med Virol. 2020;92(7):797­806. doi:10.1002/jmv.25783.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Wan S, Xiang Y, Fang W, et al. Clinical features and treatment of COVID-19 patients in northeast Chongqing. J Med Virol. 2020;92(7):797-806. doi: 10.1002/jmv.25783.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Atila A, Alay H, Yaman ME, et al. The serum amino acid profile in COVID­19. Amino Acids. 2021;53(10):1569­88. doi:10.1007/S00726­021­03081­w.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Atila A, Alay H, Yaman ME, et al. The serum amino acid profile in COVID-19. Amino Acids. 2021;53(10):1569-1588. doi: 10.1007/s00726-021-03081-w.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Whittaker A, Anson M, Harky A. Neurological Manifestations of COVID­19: A systematic review and current update. Acta Neurol Scand. 2020;142(1):14­22. doi:10.1111/ane.13266.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Whittaker A, Anson M, Harky A. Neurological Manifestations of COVID-19: A systematic review and current update. Acta Neurol Scand. 2020 Jul;142(1):14-22. doi: 10.1111/ane.13266.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Synakiewicz A, Stanislawska­ Sachadyn A, Sawicka­ Zukowska M, et al. Plasma free amino acid profiling as metabolomic diagnostic and prognostic biomarker in pediatric cancer patients: a follow­up study. Amino Acids. 2021;53(1):133­8. doi:10.1007/s00726­020­02910­8.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Synakiewicz A, Stanislawska-Sachadyn A, Sawicka-Zukowska M, et al. Plasma free amino acid profiling as metabolomic diagnostic and prognostic biomarker in pediatric cancer patients: a follow-up study. Amino Acids. 2021;53(1):133-138. doi: 10.1007/s00726-020-02910-8.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Philips AM, Khan N. Amino acid sensing pathway: a major check point in the pathogenesis of obesity and COVID­19. Obes Rev. 2021;22(4):e13221. doi:10.1111/obr.13221.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Philips AM, Khan N. Amino acid sensing pathway: a major check point in the pathogenesis of obesity and COVID-19. Obes Rev. 2021;22(4):e13221. doi: 10.1111/obr.13221.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Rees CA, Rostad CA, Mantus G, et al. Altered amino acid profile in patients with SARS­CoV­2 infection. Proc Natl Acad Sci USA. 2021;118(25):e2101708118. doi:10.1073/pnas.2101708118.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Rees CA, Rostad CA, Mantus G, et al. Altered amino acid profile in patients with SARS-CoV-2 infection. Proc Natl Acad Sci U S A. 2021;118(25):e2101708118. doi: 10.1073/pnas.2101708118.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit11"><label>11</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Paez­ Franco JC, Torres­ Ruiz J, Sosa­ Hernandez VA, et al. Metabolomics analysis reveals a modified amino acid metabolism that correlates with altered oxygen homeostasis in COVID­19 patients. Sci Rep. 2021;11(1):6350. doi:10.1038/s41598­021­85788­0.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Paez-Franco JC, Torres-Ruiz J, Sosa-Hernandez VA, et al. Metabolomics analysis reveals a modified amino acid metabolism that correlates with altered oxygen homeostasis in COVID-19 patients. Sci Rep. 2021;11(1):6350. doi: 10.1038/s41598-021-85788-0.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit12"><label>12</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Song JW, Lam SM, Fan X, et al. Omics­driven systems interrogation of metabolic dysregulation in covid­19 pathogenesis. Cell Metab. 2020;32:1­15. doi:10.1016/j.cmet.2020.06.016.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Song JW, Lam SM, Fan X, et al. Omics-driven systems interrogation of metabolic dysregulation in covid-19 pathogenesis. Cell Metab. 2020;32:1–15. doi: 10.1016/j.cmet.2020.06.016.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit13"><label>13</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Barberis E, Timo S, Amede E, et al. Large­ Scale Plasma Analysis Revealed New Mechanisms and Molecules Associated with the Host Response to SARS­CoV­2. Int J Mol Sci. 2020;21(22):8623. doi:10.3390/ijms21228623.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Barberis E, Timo S, Amede E, et al. Large-Scale Plasma Analysis Revealed New Mechanisms and Molecules Associated with the Host Response to SARS-CoV-2. Int J Mol Sci. 2020;21(22):8623. doi: 10.3390/ijms21228623.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit14"><label>14</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Danlos FX, Grajeda­ Iglesias C, Durand S, et al. Metabolomic analyses of COVID­19 patients unravel stage­ dependent and prognostic biomarkers. Cell Death Dis. 2021;12(3):258. doi:10.1038/S41419­021­03540­y.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Danlos FX, Grajeda-Iglesias C, Durand S, et al. Metabolomic analyses of COVID-19 patients unravel stage-dependent and prognostic biomarkers. Cell Death Dis. 2021;12(3):258. doi: 10.1038/s41419-021-03540-y.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit15"><label>15</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Caterino M, Costanzo M, Fedele R, et al. The Serum Metabolome of Moderate and Severe COVID­19 Patients Reflects Possible Liver Alterations Involving Carbon and Nitrogen Metabolism. Int J Mol Sci. 2021;22(17):9548. doi:10.3390/ijms22179548.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Caterino M, Costanzo M, Fedele R, et al. The Serum Metabolome of Moderate and Severe COVID-19 Patients Reflects Possible Liver Alterations Involving Carbon and Nitrogen Metabolism. Int J Mol Sci. 2021;22(17):9548. doi: 10.3390/ijms22179548.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit16"><label>16</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Shen B, Yi X, Sun Y, et al. Proteomic and Metabolomic Characterization of COVID­19 Patient Sera. Cell. 2020;182(1):59­72. e15. doi:10.1016/j.cell.2020.05.032.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Shen B, Yi X, Sun Y, et al. Proteomic and Metabolomic Characterization of COVID-19 Patient Sera. Cell. 2020;182(1):59-72.e15. doi: 10.1016/j.cell.2020.05.032.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit17"><label>17</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Thomas T, Stefanoni D, Reisz JA, et al. COVID­19 infection alters kynurenine and fatty acid metabolism, correlating with IL­6 levels and renal status. JCI Insight. 2020;5(14):e140327. doi:10.1172/jci.insight.140327.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Thomas T, Stefanoni D, Reisz JA, et al. COVID-19 infection alters kynurenine and fatty acid metabolism, correlating with IL-6 levels and renal status. JCI Insight. 2020;5(14):e140327. doi: 10.1172/jci.insight.140327.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit18"><label>18</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Ceballos FC, Virseda­ Berdices A, Resino S, et al. Metabolic Profiling at COVID­19 Onset Shows Disease Severity and Sex­ Specific Dysregulation. Front. Immunol. 2022;13:925558. doi:10.3389/fimmu.2022.925558.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Ceballos FC, Virseda-Berdices A, Resino S, et al. Metabolic Profiling at COVID-19 Onset Shows Disease Severity and Sex-Specific Dysregulation. Front. Immunol. 2022;13:925558. doi: 10.3389/fimmu.2022.925558.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit19"><label>19</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Valdés A, Moreno LO, Rello SR, et al. Metabolomics study of COVID­19 patients in four different clinical stages. Sci Rep. 2022;12(1):1650. doi:10.1038/s41598­022­05667­0.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Valdés A, Moreno LO, Rello SR, et al. Metabolomics study of COVID-19 patients in four different clinical stages. Sci Rep. 2022;12(1):1650. doi: 10.1038/s41598-022-05667-0.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit20"><label>20</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Maltais­ Payette I, Lajeunesse­ Trempe F, Pibarot P, et al. Association between Circulating Amino Acids and COVID­19 Severity. Metabolites. 2023;13(2):201. doi:10.3390/metabo13020201.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Maltais-Payette I, Lajeunesse-Trempe F, Pibarot P, et al. Association between Circulating Amino Acids and COVID-19 Severity. Metabolites. 2023;13(2):201. doi: 10.3390/metabo13020201.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit21"><label>21</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Ozturk A, Bayraktar N, Bayraktar M, et al. Evaluation of amino acid profile in serum of patients with Covid­19 for providing a new treatment strategy. J Med Biochem. 2022;41(4):526­33. doi:10.5937/jomb0­37514.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Ozturk A, Bayraktar N, Bayraktar M, et al. Evaluation of amino acid profile in serum of patients with Covid-19 for providing a new treatment strategy. J Med Biochem. 2022;41(4):526-533. doi: 10.5937/jomb0-37514.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit22"><label>22</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Stanifer ML, Kee C, Cortese M, et al. Critical Role of Type III Interferon in Controlling SARS­CoV­2 Infection in Human Intestinal Epithelial Cells. Cell Rep. 2020;32(1):107863. doi:10.1016/j.celrep.2020.107863.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Stanifer M.L., Kee C., Cortese M., et al. Critical Role of Type III Interferon in Controlling SARS-CoV-2 Infection in Human Intestinal Epithelial Cells. Cell Rep. 2020;32(1):107863. doi: 10.1016/j.celrep.2020.107863.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit23"><label>23</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Danchin A, Marlière P. Cytosine drives evolution of SARS­CoV­2. Environ Microbiol. 2020;22(6):1977­85. doi:10.1111/1462­2920.15025.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Danchin A, Marlière P. Cytosine drives evolution of SARS-CoV-2. Environ Microbiol. 2020 Jun;22(6):1977-1985. doi: 10.1111/1462-2920.15025.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit24"><label>24</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Perła­ Kaján J, Jakubowski H. COVID­19 and One­ Carbon Metabolism. Int J Mol Sci. 2022; 23(8):4181. doi:10.3390/ijms23084181.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Perła-Kaján J, Jakubowski H. COVID-19 and One-Carbon Metabolism. International Journal of Molecular Sciences. 2022; 23(8):4181. doi: 10.3390/ijms23084181.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit25"><label>25</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Silvagno F, Vernone A, Pescarmona GP. The Role of Glutathione in Protecting against the Severe Inflammatory Response Triggered by COVID­19. Antioxidants. 2020;9(7):624. doi:10.3390/antiox9070624.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Silvagno F, Vernone A, Pescarmona GP. The Role of Glutathione in Protecting against the Severe Inflammatory Response Triggered by COVID-19. Antioxidants. 2020; 9(7):624. doi: 10.3390/antiox9070624.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit26"><label>26</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Bramer LM, Hontz RD, Eisfeld AJ, et al. Multi­omics of NET formation and correlations with CNDP1, PSPB, and L­cystine levels in severe and mild COVID­19 infections. Heliyon. 2023;9(3):e13795. doi:10.1016/j.heliyon.2023.e13795.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Bramer LM, Hontz RD, Eisfeld AJ, et al. Multi-omics of NET formation and correlations with CNDP1, PSPB, and L-cystine levels in severe and mild COVID-19 infections. Heliyon. 2023;9(3):e13795. doi: 10.1016/j.heliyon.2023.e13795.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit27"><label>27</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Páez­ Franco JC, Maravillas­ Montero JL, Mejía­ Domínguez NR, et al. Metabolomics analysis identifies glutamic acid and cystine imbalances in COVID­19 patients without comorbid conditions. Implications on redox homeostasis and COVID­19 pathophysiology. PLoS One. 2022;17(9):e0274910. doi:10.1371/journal.pone.0274910.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Páez-Franco JC, Maravillas-Montero JL, Mejía-Domínguez NR, et al. Metabolomics analysis identifies glutamic acid and cystine imbalances in COVID-19 patients without comorbid conditions. Implications on redox homeostasis and COVID-19 pathophysiology. PLoS One. 2022;17(9):e0274910. doi: 10.1371/journal.pone.0274910.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit28"><label>28</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Galli F, Marcantonini G, Giustarini D, et al. How Aging and Oxidative Stress Influence the Cytopathic and Inflammatory Effects of SARS­CoV­2 Infection: The Role of Cellular Glutathione and Cysteine Metabolism. Antioxidants (Basel). 2022;11(7):1366. doi:10.3390/antiox11071366.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Galli F, Marcantonini G, Giustarini D, et al. How Aging and Oxidative Stress Influence the Cytopathic and Inflammatory Effects of SARS-CoV-2 Infection: The Role of Cellular Glutathione and Cysteine Metabolism. Antioxidants (Basel). 2022;11(7):1366. doi: 10.3390/antiox11071366.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit29"><label>29</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Kryukov EV, Ivanov AV, Karpov VO, et al. Plasma S­Adenosylmethionine Is Associated with Lung Injury in COVID­19. Dis Markers. 2021;2021:7686374. doi:10.1155/2021/7686374.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kryukov EV, Ivanov AV, Karpov VO, et al.. Plasma S-Adenosylmethionine Is Associated with Lung Injury in COVID-19. Dis Markers. 2021;2021:7686374. doi: 10.1155/2021/7686374.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit30"><label>30</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Cai Y, Kim DJ, Takahashi T, et al. Kynurenic acid may underlie sexspecific immune responses to COVID­19. Sci Signal. 2021;14. eabf8483. doi:10.1126/scisignal.abf8483.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Cai Y, Kim DJ, Takahashi T, et al. Kynurenic acid may underlie sex-specific immune responses to COVID-19.Sci. Signal. 2021;14,eabf8483. doi: 10.1126/scisignal.abf8483.</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
