Работа в условиях пандемии COVID-19 – опыт биобанка ФГБУ «НМИЦ онкологии» Минздрава России

Цель. Представить основные результаты и характер изменения работы биобанка ФГБУ “НМИЦ онкологии” Минздрава России во время пандемии новой коронавирусной инфекции (COVID-19).

Материал и методы. В работе представлен анализ динамики поступления свежезамороженных биообразцов прооперированных пациентов за 3 квартала 2019 и 2020гг, а также рассмотрены возможные пути реализации научно-исследовательских проектов по сбору и депонированию материалов для биобанка в условиях пандемии COVID-19. В соответствии с реализуемыми научно-исследовательскими проектами в работу были включены лица старше 18 лет с первичным характером новообразований органов желудочно-кишечного тракта, при госпитализации давшие информированное согласие о передаче биологического материала в биобанк. Одним из условий включения стало наличие отрицательного результата мазка из носоглотки на SARS-CoV-2, полученного методом полимеразной цепной реакции. Подсчет данных, сравнительный анализ результатов осуществляли с применением пакета программ Microsoft Office Excel.

Результаты. При подсчете процентного соотношения депонированного материала за 2 года, выяснилось, что в 2019г за первый квартал поступило 34% биопрепаратов от общего количества за год, в 2020г — 50%. За второй квартал 2019г — 35%. Особенностью второго квартала 2020г стало изменение в графике работы учреждений в связи с пандемией COVID-19, что послужило причиной снижения количества криообразцов на 56% в сравнении с тем же периодом за 2019г. Рекордно низкий показатель соответствует 14% от общего количества собранного материала за 3 квартала 2020г. В третьем квартале 2020г поток поступившего материала был восстановлен и составил — 65 пациентов, что соответствует 36% от общего объема собираемого материала в настоящем году и на 23% больше, чем в 2019г.

Заключение. За счет сложившейся ситуации, связанной с пандемией COVID-19 и острой эпидемиологической обстановкой в стране, критическое снижение количества депонированного материала во втором квартале 2020г определило необходимость адаптации существующих правил ведения отечественного биобанкирования и биобанка “НМИЦ онкологии” в частности. Возможные пути адаптации организации и проведения научно-исследовательских проектов в сложившихся условиях могут заключаться в создании совместных тематических проектов между группами ученых различных организаций с обязательным учетом требований информационной и биологической безопасности. Данная проблема и пути её решения широко обсуждались на международных и отечественных площадках, в т.ч. на 4-ом научном заседании Национальной ассоциации биобанков и специалистов по биобанкированию (НАСБИО), посвященном вопросам организации биобанкирования в период пандемии COVID-19.

1. WHO Director-General’s remarks at the media briefing on 2019-nCoV on 11 February 2020. World Health Organization, Geneva. https://www. who. int/dg/speeches/detail/who-director-general-s-remarks-at-the-media-briefing-on-2019-ncov-on-11-february-2020. (11 Feb 2020)

2. Deshmukh V, Tripathi SC, Pandey A et al. COVID-19: a conundrum to decipher. Eur Rev Med Pharmacol Sci. 2020;24(10):5830-41. doi: 10.26355/eurrev_202005_21378

3. Yi Y, Lagniton PhNP, Ye S et al. COVID-19: what has been learned and to be learned about the novel coronavirus disease. International journal of biological sciences. 2020;16(10):1753-66. doi: 10.7150/ijbs.45134

4. Joob B, Wiwanitkit V. Letter to the editor: coronavirus disease 2019 (COVID-19), infectivity, and the incubation period. Journal of Preventive Medicine and Public Health. 2020;53(2):70. doi: 10.3961/jpmph.20.065

5. Khanji MY, Chahal AA, Aung N et al. COVID-19 and the UK biobank-opportunities and challenges for research and collaboration with other large population studies. Front. Cardiovasc. Med. 2020;7:156. doi.org/10.3389/fcvm.2020.00156

6. Stergachis AB, Weiss ST, Green RC. Biobanks could identify medically actionable findings relevant for COVID-19 clinical care. Nature Medicine. 2020;26(70):991. https://doi.org/10.1038/s41591-020-0953-x

7. Henderson MK, Kozlakidis Z, Fachiroh J et al. The Responses of Biobanks to COVID-19. Biopreservation and Biobanking. https://doi.org/10.1089/bio.2020.29074.mkh (31 Aug 2020)